Selección genómica en Eucalyptus dunnii: comparación de predicciones obtenidas empleando una estrategia de Genotipado por secuenciación y el sistema comercial de SNP EuChip60K

AGUIRRE, NATALIA C.; VILLALBA, PAMELA V.; CARLA FILIPPI; RIVAS, JUAN G.; GARCIA MARTIN N.; ACUÑA, CINTIA V.; MARTINEZ MARÍA CAROLINA; LÓPEZ, JUAN A.; LÓPEZ A. J.; PABLO S. PATHAUER; PALAZZINI, DINO A.; HARRAND, LEONEL; OBERSCHELP, GUSTAVO P. J.; MARTÍN MARCÓ; CISNEROS, FELIPE E.; ROCIO CARRERAS; RODRIGUES J.; CAPPA, EDUARDO PABLO; NORMA PANIEGO; HORACIO ESTEBAN HOPP; GRATTAPAGLIA, DARIO; MARCUCCI POLTRI, SUSANA N.

Buenos Aires

Simposio; XIII SIMPOSIO REDBIO ARGENTINA 2021 VIRTUAL: ?La Biotecnología como Solución a Desafíos Pasados, Presentes y Futuros?; 2021

REDBIO ARGENTINA

Eucalyptus dunnii Maiden ha cobrado mayor relevancia a nivel mundial en los últimosaños por combinar crecimiento, rectitud de fuste y buenas cualidades para pulpa parapapel con potencial para otros usos; siendo una alternativa en áreas templadas y conmayor frecuencia de heladas.En Argentina, el INTA desde 1991 cuenta con un Programa de Mejoramiento Genéticopara la especie de amplia base genética y actualmente ofrece al sector productivo semillamejorada localmente para crecimiento y rectitud de fuste. La estrategia de SelecciónGenómica (SG) permite predecir fenotipos a partir de modelos que emplean datosgenómicos y fenotípicos (GBLUP) e incluyendo el pedigrí (ssGBLUP).En este trabajo se genotiparon 280 árboles de una población de E. dunnii de 1520árboles, aplicando un sistema comercial de 60.000 SNPs (EuChip60K) y una estrategiade Double digest Restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq) puesta apunto para esta especie en particular; obteniendo 8.170 (ddRADSeq) y 19.045(EUChip60K) SNPs (datos perdidos por SNP 0,01, LD: r2>0,2).Se compararon los desempeños de ambas metodologías de genotipificación paraGBLUP y ssGBLUP sobre 14 caracteres relacionados con crecimiento y propiedadesquímicas de la madera. Para cada modelo se aplicaron 10 validaciones cruzadas (90:10)y se compararon (pruebas t pareadas, p