INVESTIGADORES
GARCIA Cybele Carina
congresos y reuniones científicas
Título:
"Búsqueda de factores celulares antivirales a través de ensayos de alto rendimiento"
Autor/es:
C. C. GARCÍA
Lugar:
Buenos Aires
Reunión:
Congreso; X Congreso Argentino de Virologia; 2011
Institución organizadora:
SAV
Resumen:
El virus dengue (DENV) es un arbovirus de la familia Flaviviridae
que presenta cuatro serotipos (DENV-1
a DENV-4) y son transmitidos al hombre por mosquitos del
género Aedes. La
infección resulta en un amplio espectro clínico que abarca desde infecciones
inaparentes, hasta formas más severas de fiebre hemorrágica de dengue y
síndrome de shock de dengue. En la actualidad no hay vacunas ni agentes
quimioterapéuticos específicos disponibles para prevención o tratamiento del
dengue, por lo que representa una de las prioridades en el desarrollo de
antivirales.
Con el objetivo de identificar factores celulares antivirales, en el
presente trabajo se propuso el uso combinado de microarreglos (microarrays) en conjunto con el
mecanismo de interferencia de ARN, a través de ensayos de alto rendimiento (high throughtput screening).
En primer lugar, se utilizaron microarreglos de ADN para analizar la
expresión génica de varias líneas celulares infectadas con DENV-2. A partir de los perfiles
obtenidos en las muestras fueron identificados 75 genes relacionados con la
inmunidad innata que resultaron estar sobreexpresados en todas las líneas
celulares luego de 24 y 48 horas post infección. Luego, en forma complementaria
se utilizaron vectores lentivirales que expresan pequeños ARN con estructura de
horquilla (small hairpin RNAs, shRNAs)
con el fin de silenciar la expresión de los mismos y definir así su potencial
antiviral.
Para ello, se pusieron a punto las condiciones que permitieran la
transducción de células con 5 shRNAs redundantes dirigidos hacia cada uno de
los 75 genes, seguido de una infección con DENV-2, a través de ensayos de alto
rendimiento utilizando un sistema automatizado provisto por el Broad Institute
(EEUU). Los resultados se analizaron mediante ensayos de inmunofluorescencia
indirecta revelando la expresión de la proteína NS3 del virus dengue, y por RT-PCR
cuantitativa detectando genoma viral.
A partir de este nuevo estudio, se identificaron 23 genes con propiedades antivirales.
Algunos de estos genes ya habían sido identificados por otros grupos de
investigación, como PKR, RIG-I, IFITM2, CASP3, sin embargo el análisis también
reveló nuevos genes como TRIM19, GMPR, DUSP5,
CD38, IFI27, IFI35, GBP1, SP110, IFI6, que constituyen interesantes
perspectivas de investigación en el campo antiviral. En particular, nuestro grupo de trabajo se
ha enfocado en estudiar el rol de TRIM19 (proteína de la leucemia
promielocítica, PML) en la infección con DENV. Los ensayos preliminares demuestran
que esta proteína podría cumplir una función antiviral clave en la progresión
del ciclo de replicación de DENV, por lo que concluimos que
la combinación del análisis aleatorio de la respuesta génica de células
infectadas (microarreglos), en conjunto con el silenciamiento de genes mediante
shRNAs, constituyen un abordaje muy útil en ensayos de alto rendimiento para
caracterizar nuevos factores celulares antivirales.