Genomas como Bosques. Mucho más que una analogía poética

HERNÁN DOPAZO

Salta

Congreso; XLII Congreso Argentino de Genética; 2013

Sociedad Argentina de Genética

Genomas como BosquesMucho más que una analogía poéticaHernán DopazoIEGEBA? CONICET ? UBA¿Hay alguna relación entre los patrones de abundancia y diversidad de especies enlas comunidades ecológicas y en los elementos que contribuyen a la diversidad desecuencias de los genomas eucariotas? ¿En qué medida la abundancia y diversidadde los componentes de un genoma eucariota refleja la acción de procesosadaptativos o neutrales?En esta conferencia mostraré que un único proceso estocástico asociado a unescaso número de parámetros permite ajustar el patrón de abundancia relativa y dediversidad de especies genéticas ("SINEs, LINEs, LTR, small-RNA, DNATransposons,Satellite, Simple-Repeat, Low- Complexity", etc) a lo largo de una grandiversidad de genomas eucariotas desde los organismos unicelulares del planctonhasta los mamíferos. Para ello hemos desarrollado una formulacióngenómica derivada de la Teoría Neutra de la Biodiversidad de StephenHubbell desarrollada para la ecología de comunidades e inspirada originalmente enel neutralismo evolutivo de Motoo Kimura y Sewal Wright.Nuestro estudio aplicado a más de 450 cromosomas de organismos eucariotas nopuede rechazar la hipótesis que formula que la abundancia y la diversidad deelementos funcionales y no funcionales observada en los genomas eucariotas, esconsecuencia de un proceso fundamentalmente neutro, donde la selección naturalparece no haber dejado huella.Por lo tanto hipotetizamos que a grandes escalas temporales y espaciales en almenos los dos extremos de la organización biológica (genomas y comunidades) unproceso neutral o casi neutral general gobierna la evolución de la diversidad y laabundancia de sus componentes.¿Por qué las diferencias adaptativas de nicho resultan superfluas a escala decomunidades ecológicas o genomas? Los ecólogos piensan que distintos ?tradeoffs?podrían compensar las diferencias selectivas de especies en los ecosistemas;por ejemplo, las especies con altas tasas de dispersión no son buenas competidoraslocales. En los genomas aún no hay evidencias sobre compensaciones selectivas,aunque se comienza a reconocer el papel neutral de la enorme abundancia detranscriptos del genoma humano como lo ha demostrado el consorcio ENCODE