Estimación de la interacción genotipo-ambiente en selección genómica

RUEDA CALDERÓN, A.; BRUNO, C.; BALZARINI, M.

Catamarca

Congreso; XLVI Congreso Argentino de Genética; 2017

En los ensayos multiambientales (Multienvironment trials, MET) donde se evalúan genotipos (G) en diferentes ambientes (A) es posible identificar fuentes de variación atribuibles a efectos de la interacción genotipo-ambiente (G×A). La información proveniente de marcadores moleculares ha permitido estudiar la asociación genotipo-fenotipo y avanzar hacia la selección genómica (SG). Sin embargo, aún existen desafíos metodológicos para incorporar el efecto de la interacción G×A en los modelos de asociación genómica. En este trabajo se comparan dos estrategias de incorporación de la interacción G×A en el modelo de SG, una trata al fenotipo en cada ambiente como un vector respuesta multivariado para estimar la correlación de los rankings de G entre A, y considera separadamente la correlación genética derivada de la matriz de datos moleculares. La segunda estrategia incorpora la correlación producto (kronecker) de los efectos ambientales y de relaciones genotípicas. Los resultados de ambos modelos fueron comparados con un modelo lineal mixto (MLM) para cada ambiente con efecto aleatorio de genotipo. Se ilustran los procedimientos a partir de una base de datos de trigo pública disponible en el paquete BGLR de R que contiene información molecular de 599 líneas de trigo y cuatro años de rendimiento, considerados como cuatro ambientes diferentes. Ambas estrategias para considerar GxA produjeron resultados similares e identificaron con mayor precisión los marcadores de mayor contribución para la SG que el MLM por ambientes.