Control de la tasa de falsos descubrimientos en estudios de asociación con poblaciones estructuradas

PEÑA MALAVERA, A.; GUTIERREZ, L.; BALZARINI, M.

Buenos Aires

Congreso; 1° Congreso Argentino de Estadística (CAE I) XLIII Coloquio Argentino de Estadística XX Reunión Científica del GAB; 2015

Grupo Argentino de Biometría y Sociedad Argentina de Estadística

Las pruebas de asociación entre marcadores moleculares (datos genómicos) y variables fenotípicas son necesarias para la identificación de QTL (Quantitative Trait Loci) en mejoramiento genético. Múltiples marcadores genéticos deben ser simultáneamente evaluados respecto a su asociación con el fenotipo; consecuentemente, la corrección de valores-p por multiplicidad es común en este tipo de estudios. Sin embargo, las correcciones estadísticas usadas, como Bonferroni y otros métodos de control de la tasa de falsos descubrimientos (FDR), no fueron desarrolladas en el contexto de datos con estructura de correlación, como los que surgen en estudios de asociación con poblaciones genéticamente estructuradas. En este trabajo, proponemos un método de corrección por multiplicidad basado en la estimación del número efectivo de pruebas realizada con el estadístico de Mantel y Haenzel para describir asociación entre marcadores, controlando por la estructura genética subyacente. El desempeño del procedimiento propuesto es analizado vía simulación. Los resultados sugieren que el método denominado MLJ, provee un buen control de la tasa de falsos positivos y tiene mayor potencia que otros métodos de ajuste comúnmente usados en estudios de asociación.