Groundnut ringspot virus: estructura y organización genómica.

DE BREUIL, S.; CAÑIZARES SALES, J.; BLANCA POSTIGO, J.M.; BEJERMAN, N.; TRUCCO, V.M.; GIOLITTI, F.; ZIARSOLO, P.; LENARDON, S.

Tucumán

Congreso; 3° Congreso Argentino de Fitopatología.; 2014

Asociación Argentina de Fitopatólogos.

Groundnut ringspot virus (GRSV) es un miembro del género Tospovirus que infecta cultivos de importancia económica. Puesto que la caracterización molecular del mismo contribuye a entender las interacciones virus-planta-vector, nuestro objetivo fue conocer la estructura genómica del GRSV. Los RNAs pequeños de una planta de maní infectada con GRSV se secuenciaron en un equipo Illumina HiSeq 2000 (Fasteris SA, Suiza). Se obtuvo una secuencia consenso por mapeo de las lecturas contra la secuencia más relacionada, y se definieron los marcos abiertos de lectura (ORFs) y las proteínas predichas con los programas ORF Finder y blastp del NCBI, respectivamente. El RNA L (8876 nt), de polaridad negativa, presentó un único ORF (nt 8842 a 218) perteneciente a la polimerasa viral (2874 aa). Los RNA M (4848 nt) y S (3067 nt) mostraron una estrategia de codificación ambisentido, con ORFs separados por una región intergénica rica en A+T. El ARN M presentó un ORF (nt 101 a 1011) que codifica la proteína de movimiento (303 aa) y otro ORF (nt 4764 a 1360) responsable de la proteína precursora de las glicoproteínas G1/G2 (1134 aa). El RNA S mostró dos ORFs (nt 88 al 1491 y nt 2961 al 2140) que codifican para la proteína supresora del silenciamiento génico (467 aa) y la nucleocápside (258 aa), respectivamente. Los RNA L, M y S presentaron la secuencia terminal consenso en los extremos 3? y 5? propia de miembros de los Tospovirus y todas las proteínas mostraron dominios conservados. Este es el primer estudio sobre la organización genómica de un Tospovirus en Argentina.