Perfil transcriptómico de la respuesta a frío de Triticum turgidum ssp durum en etapa reproductiva

DÍAZ, MARINA LUCÍA; CARRERA, ALICIA; SORESI, DANIELA; CUPPARI, SELVA

Rosario

Simposio; Simposio de Genómica Funcional de Plantas.; 2017

El trigo candeal se cultiva principalmente en el sur de la provincia de Buenos Aires, donde se producen heladas hasta finales de octubre. El objetivo fue identificar genes y vías metabólicas relacionadas con la respuesta a frío en etapa reproductiva. Se partió de hojas bandera de plantas espigadas de la línea CBW0101 (primaveral, buen comportamiento frente a heladas). Las plantas fueron expuestas a rampa de 15 a 5°C donde permanecieron 5 hs y se procedió a la extracción de ARN (tres réplicas biológicas). Plantas control permanecieron a 22◦C/16◦C. El secuenciado se realizó con plataforma Illumina (INDEAR). Se obtuvieron 301 Mi de lecturas de calidad y el ensamblado de novo con Trinity generó 113.715 unigenes de los cuales el 42% presentó anotación funcional con SwissProt, PFAM y Gene Onthology (GO). El mapeo de vías metabólicas se realizó con la base Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Se detectaron 966 genes con expresión diferencial (p≤0,001), de los cuales 619 presentaron mayor expresión en las plantas sometidas a frío. La categoría Procesos Biológicos (GO) incluyó 17 ítems diferencialmente representados (inducción por frío). KEGG mostró que las vías del metabolismo de almidón y sacarosa, las de cisteína y metionina, las de biosíntesis de aminoácidos y ritmo circadiano fueron las más representadas en las plantas tratadas.Entre los genes con expresión diferencial se identificaron factores de transcripción asociados a estrés: WRKY, AP2, DREB, MYB, bZIP y bHLH. Los genes inducidos representan candidatos para tolerancia a frío de un trigo candeal primaveral en estado reproductivo.