Análisis comparativo de poblaciones de retrotransposones LTR que habitan los genomas de Solanum pennelli y Solanum lycopersicum

ANDINO NATALIA; YAÑEZ ANAHÍ; PAZ ROSALIA

Jornada; II Reunión Argentina de Jóvenes Botánicos; 2016

Solanum pennelli es una especie de tomate silvestre endémica de la región de los Andes en América del Sur. Mientras que Solanum lycopersicum es una especie domesticada de alto valor económico por su importancia agronómica. Ambas especies son muy divergentes dentro de la familia Solanáceas, pero lo suficientemente relacionadas para producir progenie viable. El tamaño del genoma haploide de S. pennellii ha sido estimado en ~ 1.200 Mb, y en S. lycopersicum ~ 950 Mb, donde las diferencias en el tamaño es atribuido principalmente a la acumulación de retroelementos LTR. En este estudio se identificaron los LTR potencialmente activos en ambas especies considerando la selección estructural, funcional como así también el tiempo de inserción. Se identificaron entre los genomas diferencias numéricas y diferencias en las proporciones Copia:Gypsy (C:G), encontrándose casi 3 veces más retroelementos LTR y una alta proporción C:G en el tomate silvestre que en la especie cultivada. La mayoría de las familias de retroelementos LTR identificados previamente en S. lycopersicum estuvieron también presentes en S. pennelli. Además, algunas familias identificadas en el tomate cultivado en un alto número como GypsySL_01 y CopiaSL_37 fueron también abundantes en la especie silvestre. Sin embargo, observamos diferencias en la estimación del tiempo de inserción de las familias de los retroelementos LTR, revelando una reciente divergencia en las poblaciones de retroelementos en ambas especies. Se discutirá la aplicación de esta información para el diseño de marcadores moleculares. Financiamento: DTEC 0008/13 (MINCyT, Argentina)