CIFASIS 20631
CENTRO INTERNACIONAL FRANCO ARGENTINO DE CIENCIAS DE LA INFORMACION Y DE SISTEMAS
Unidad Ejecutora - UE
congresos y reuniones científicas
Título:
Predicción funcional GO de genes co-localizados en tomate mediante métodos de aprendizaje computaciona
Autor/es:
P. BULACIO; F. KRSTICEVIC; F. SPETALE; E. TAPIA
Lugar:
Rosario
Reunión:
Congreso; XVII Congreso y XXXV Reunión anual de la Sociedad de Biología de Rosario; 2015
Institución organizadora:
Sociedad de Biología de Rosario
Resumen:
La anotación de genes en GO mediante métodos bioinformáticos brinda una primera aproximación de las actividades biológicas subyacentes. Tradicionalmente, se basan en similitudes de subsecuencias frente a secuencias anotadas. Sin embargo, con similitudes poco claras, los métodos de ensamble de clasificación jerárquica basados en aprendizaje computacional resultan promisorios. Estos métodos usan clasificadores binarios de funciones GO elementales (clases) sujetos a la restricción True Path Graph (TPG), garantizando la consistencia de relaciones entre clases; i.e., para relación is_a, TPG indica que genes anotados con una clase deben anotarse también con sus ancestros.
