INVESTIGADORES
PERUCHENA Nelida Maria
congresos y reuniones científicas
Título:
Energia de interaccion entre fragmentos de arabinogalactano tipo II presente en
Autor/es:
BENITEZ, ELISA; LOZANO, JORGE E.; PERUCHENA, N. M.
Lugar:
San Rafael, Mendoza, Argentina.
Reunión:
Congreso; Congreso Latinoamericano de Ingenieria y Ciencias Aplicadas - CliCap; 2009
Institución organizadora:
Universidad Nacional de Cuyo
Resumen:
En este trabajo se estudio la variaci¨®n de la barrera de energ¨ªa, entre fragmentos de
oligosacaridos presentes en part¨ªculas coloidales de jugos manzana, por cambios en la
orientaci¨®n de los fragmentos analizados, utilizando la simulaci¨®n computacional. Para
ello se selecciono un fragmento representativo de Arabinogalactano tipo II, un
oligosacarido formado por una cadena principal, un tetra sac¨¢rido ([b-D-Galp-(1¡ú3)]4)
y una ramificaci¨®n formada por un disac¨¢rido (a-L-Araf-(1¡ú6)-[b-D-Galp-(1¡ú6)]),
con uni¨®n 1-6 entre la b-D-Galp de la cadena lateral y una ¦Â-D-Galp de la cadena
principal. Se colocaron dos mol¨¦culas de oligosacaridos en una caja conteniendo 1000
mol¨¦culas de agua, para evaluar el efecto del solvente. Las estructuras del oligosacarido
y de las mol¨¦culas de agua fueron generadas por simulaci¨®n computacional con el
m¨¦todo de Metr¨®polis Monte Carlo (MC), usando el programa DICE. Se considero la
interacci¨®n intermolecular entre dos mol¨¦culas de oligosacarido, descripta por el
potencial intermolecular Coulombico mas el de Lennard-Jones, usando el campo de
fuerza AMBER para oligosacaridos y el modelo SPC para el agua. Luego de un
periodo de equilibracion de 1x105 pasos se llevo a cabo la simulaci¨®n con 1,5x106
pasos. Se realizaron en total 12 simulaciones, 6 para cada variaci¨®n de la orientaci¨®n de
los oligosacaridos, variando la distancia de separaci¨®n entre ellos cada 0,05 nm.
Debido a que el oligosacarido presenta una distribuci¨®n de las cargas sobre la superficie
se ubico las part¨ªculas: i) orientadas enfrentando los potenciales positivos y ii)
orientadas enfrentando potenciales electrost¨¢ticos de signo contrario. En ambos casos se
observo una barrera de energ¨ªa cercana a los 1,9 nm de distancia de separaci¨®n de las
part¨ªculas. Sin embargo la configuraci¨®n i) presenta una barrera de energ¨ªa de 22,70
kcal/mol y la configuraci¨®n ii) una barrera de 12,95 kcal/mol. Es decir la energ¨ªa de
interacci¨®n entre part¨ªculas individuales se reduce en un 43% de la orientaci¨®n ii) con
respecto a i). Esta metodolog¨ªa de simulaci¨®n de part¨ªculas coloidales por el m¨¦todo de
MC permite comprender y dar explicaci¨®n a varios aspectos observados
experimentalmente. Asimismo permitir¨ªa predecir los cambios en la barrera de energ¨ªa
debida a variaciones no solo en la orientaci¨®n de las part¨ªculas al aproximarse sino
tambi¨¦n variaciones en la composici¨®n de las mismas, por la presencia de grupos ¨¢cidos
o grupos metilos, ambos presentes en las part¨ªculas por provenir de mol¨¦culas de
pectina degradada y que est¨¢n siendo estudiados actualmente.