INVESTIGADORES
DICKENSTEIN Alicia Marcela
congresos y reuniones científicas
Título:
Geometría algebraica computacional y redes de reacciones bioquimicas
Autor/es:
A. DICKENSTEIN
Lugar:
Santa Fe
Reunión:
Seminario; Seminario del IMAL; 2014
Institución organizadora:
IMAL
Resumen:
En los últimos años, han comenzado a usarse
exitosamente técnicas de la geometría algebraica computacional para abordar
cuestiones matemáticas en biología de sistemas. Las redes de reacciones
(bio)químicas definen sistemas de ecuaciones diferenciales ordinarias con
parámetros (en general, desconocidos). Bajo cinética de acción de masas, estas
ecuaciones dependen polinomialmente de las concentraciones de las especies
químicas. Los estados estacionarios biológicamente relevantes corresponden así
a las soluciones reales positivas de un sistema estructurado de ecuaciones
polinomiales. Estas redes típicamente no lineales han sido ampliamente
estudiadas via simulación numérica y sin un estudio comprensivo de la
dependencia en los paramétros.
La teoría algebraica de redes sistemas de reacciones
químicas apunta a entender la dinámica via la estructura algebraica de las
ecuaciones cinéticas y no necesita una determinación a priori de los
parámetros, lo que es en general práctica y teóricamente imposible. Presentaré
una introducción a los conceptos básicos y a las principales cuestiones, junto
con aplicaciones a mecanismos enzimáticos.