AMOVA: Una herramienta para el analisis de fingerprints RAPDs

GARCÍA, MV; MZ GALVÁN; PA BALATTI; MJ ARTURI

Viña del Mar - Chile

Otro; Reunión conjunta: XXIII Reunión Anual Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile, XIV Reunión Anual Sociedad de Biología Celular de Chile, XXXVI Reunión Anual Sociedad Argentina de Investigación en Bioquímica y Biología Molecular en; 2000

Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile

Los objetivos son: particionar la varianza molecular en sus componentes intra e interpoblacional y calcular la variabilidad detectada por cada "primer". El fin es establecer el menor número de "primers" que evidencie la variabilidad existente en el material en estudio. El AMOVA (Analysis of Molecular Variance) consiste en el desarrollo de un análisis clásico de la varianza de manera de análizar los componentes de la varianza de los datos moleculares en diferentes niveles jerárquicos. En términos generales, la idea central del AMOV A es convertir una matriz de distancia entreindividuos en su equivalente amilisis de varianza. Se analizaron genotipos de Paspauml dilatatum Poir. en una muestra de ocho individuos provenientes de ocho sitios de la provincia de Buenos Aires. Se utilizaron 10 “primers" que produjeron un total de 60 bandas polimórficas. Los patrones de bandas se utilizaron para construir una matriz básica de datos (MBD) sobre la que se construyó la matriz de distancia utilizando el índice métrico Euclidiano. Con el análisis de AMOV A se particionó la varianza de los fcnotipos RAPDs generados por cada cebador. Esta información permitió identificar el número de "primers", y por ende de patrones de amplificación, que es necesario analizar para establecer la diversidad genética dentro del material estudiado. Se demostró que en Paspalum dilatatum  Poir la variabilidad intra e , interpoblacional es significativa.