INVESTIGADORES
FELD Mariana
congresos y reuniones científicas
Título:
Diversidad genética de cepas circulantes en Argentina del GB virus tipo C/ Hepatitis G: caracterización mediante un nuevo método basado en el polimorfismo de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLP, secuenciación del ADN-c y análisis filogenéti
Autor/es:
QUARLERI JF; MATHET V; FELD M; FERRARIO D; DELLA LATTA MP; VERDUN R; SANCHEZ DO; OUBIÑA JR
Lugar:
Buenos Aires, Argentina
Reunión:
Congreso; X Congreso Argentino de Hepatología; 1999
Resumen:
Objetivo: Determinar la relación genética entre aislamientos virales de GBV-C / VHG de Argentina con cepas caracterizadas previamente en el mundo.
Pacientes, Materiales y Métodos: Se estudió el suero de 70 pacientes usuarios de drogas endovenosas (DEV) infectados con el VIH-1 y de 200 hemodonantes. Se amplificó el ARN del GBV-C / VHG mediante RT-Nested PCR utilizando cebadores para la región 5´NC, con una extensión de 325 - 329 nucleótidos. Se creó un sistema de tipificación genómica mediante RFLP con las endonucleasas Hinf I, Aat II y Aci I. Se secuenciaron los amplicones bidireccionalmente. Se alinearon las secuencias con el programa Clustal X. Las distancias evolutivas entre secuencias provenientes del GenBank (n=150) y las de las cepas de Argentina (n=21) se determinaron con el programa DNADIST, y se utilizaron para la construcción de árboles filogenéticos empleando el método neighbor-joining. La exactitud de éstos se estableció por remuestreo (bootstrap) con 1000 réplicas.
Resultados: Se detectó ARN viral en 21 de los 70 sueros de DEV. La prevalencia en ellos (30%) fue estadísticamente diferente a la observada en el grupo control de hemodonantes (7,5% [n=200], p<0,0001). La tipificación, la secuenciación del ADN-c y el análisis filogenético demostraron la presencia de los genogrupos 1 (n=1), 2a (n=11), 2b (n=4) y 3 (n=5). Se corroboró el árbol filogenético mediante remuestreo, confirmándose la presición del método de RFLP creado (99,4%).
Conclusiones: 1) Se describe la circulación en el país de los 3 principales genogrupos de GBV-C / VHG, en contraposición con la distribución geográfica restringida de los mismos observada en otros países; 2) Se demuestra una elevada prevalencia del GBV-C / VHG en DEV y en menor medida en hemodonantes de Argentina; 3) Se propone un nuevo método de caracterización genómica que puede ser útil para estudios epidemiológicos y / o de transmisión viral interhumana.