INVESTIGADORES
DICKENSTEIN Alicia Marcela
congresos y reuniones científicas
Título:
Geometría algebraica computacional y redes de reacciones bioquimicas
Autor/es:
A. DICKENSTEIN
Lugar:
Santa Fe
Reunión:
Conferencia; Seminario del IMAL; 2013
Institución organizadora:
IMAL, CONICET
Resumen:
En los últimos años, han
comenzado a usarse exitosamente técnicas de la geometría algebraica
computacional para abordar cuestiones matemáticas en biología de sistemas. Las
redes de reacciones (bio)químicas definen sistemas de ecuaciones diferenciales
ordinarias con parámetros (en general, desconocidos). Bajo cinética de acción
de masas, estas ecuaciones dependen polinomialmente de las concentraciones de
las especies químicas. Los estados estacionarios biológicamente relevantes
corresponden así a las soluciones reales positivas de un sistema estructurado
de ecuaciones polinomiales. Estas redes típicamente no lineales han sido
ampliamente estudiadas via simulación numérica y sin un estudio comprensivo de
la dependencia en los paramétros.
La teoría algebraica de redes sistemas de reacciones
químicas apunta a entender la dinámica via la estructura algebraica de las ecuaciones
cinéticas y no necesita una determinación a priori de los parámetros, lo que es
en general práctica y teóricamente imposible. Presentaré una introducción a los
conceptos básicos y a las principales cuestiones, junto con aplicaciones a
mecanismos enzimáticos.