Modelos de regresión con efectos aleatorios para mapeo de regiones genómicas asociadas a caracteres de expresión continua

A. ARROYO; M. BALZARINI

Córdoba

Congreso; BIOMAT; 2007

El avance en técnicas moleculares ha posibilitado la visualización del genoma a través del uso de marcadores moleculares. El estudio probabilístico de asociacion entre estos marcadores y un carácter fenotipico de expresion continua permite estimar la ubicación y el efecto de regiones genómicas responsable de la expresión de ese carácter cuantitativo (QTL, quantitative trait loci). El mapeo de QTL involucra la aplicación simultánea e iterativa de distintos métodos de análisis estadístico que van desde el análisis marcador por marcador hasta el mapeo por intervalo compuesto (CIM). La estimación mediante modelos de regresión en el CIM se basa en expresar los valores de una variable aleatoria continua (carácter quantitativo de interés) como función lineal de efectos de QTL esperados dado el estado de dos marcadores adyacentes que limitan una región genómica particular (intervalo de análisis). La variabilidad en el carácter cuantitativo debida a regiones genómicas fuera del intervalo de análisis, es controlada (separada del término de error estocástico) a través del uso de covariables que reflejan el efecto de posibles QTL asociados a otros marcadores (co-factores). En la práctica del mapeo, el investigador debe decidir el criterio a usar para selecconar los marcadores que serán usados como co-factores en el ajuste del modelo. Para evitar esa decisión proponemos una metologia estadisticaalternativa basada en el control de la variabilidad del carácter continuo no explicada por el intervalo de interés mediante el uso de efectos aleatorios de genotipo en el modelo. Se ilustra la aplicación de este modelo, en comparación con el CIM tradicional, sobre distintos escenarios de simulación.