DIVERGENCIA ESTRUCTURAL DE PROTEÍNAS: ANÁLISIS DE COMPONENTES PRINCIPALES

MADRID, MARCOS; ECHAVE, JULIAN

CÓRDOBA

Congreso; XVII CONGRESO ARGENTINO DE FISICOQUÍMICA Y QUÍMICA INORGÁNICA; 2011

Asociación Argentina de Investigación Fisicoquímica

Existen muchas técnicas para el análisis del movimiento interno de las proteínas, que intentan separar los movimientos más colectivos (de menor energía) de los menos colectivos. El verdadero reto es relacionar dichos movimientos colectivos con propiedades funcionales de las proteínas como son la unión de ligandos, la regulación o el plegamiento. Es sabido que la divergencia en la evolución de las estructuras proteicas es dominada por los modos normales de menor energía o lo que es lo mismo, los mas colectivos. Algunos autores atribuyen esto a la importancia funcional de dichos movimientos colectivos o lo que seria lo mismo, a la selección natural, mientras que otros lo relacionan con la respuesta física esperada de una proteína sujeta a mutaciones aleatorias. En este trabajo realizado con Dinámicas Moleculares encontramos, en concordancia con trabajos previos del grupo realizados con el modelominimalista de red elástica linealmente forzada (LFENM), que los modos normales de menor energía dominan no sólo los cambios estructurales entre proteínas homologas (evolutivamente relacionadas) sino también los cambios analizados con proteínas mutantes (mioglobinas mutadas aleatoriamente en laboratorio) y proteinas nativas (la misma proteína pero sujeta a perturbaciones tales como cambios en la temperatura, pH o unidas a ligandos), lo que sugiere que el modelo LFENM reproduce este tipo de comportamiento adecuadamente y con mucho menor costo computacional. Actualmente nos encontramos evaluando cálculos preliminares de divergencia en la dinámica de las mismas series de Proteínas.