SECUENCIACIÓN Y ENSAMBLADO DE NOVO DE GENOMA Y TRANSCRIPTOMA DE Galaxias maculatus

BECKER, LA; BELLORA, N; LOPEZ LAPHITZ, RM; VIOZZI, G; FLORES, V; NABAES JODAR, DN; CRICHIGNO, SA; NUGENT, CM; SACKTON, T; SIN, SYW; DANZMANN, R; EDWARDS, S; ORTÍ, G; CUSSAC, VE

Chascomús

Simposio; VII SIMPOSIO ARGENTINO DE ICTIOLOGIA; 2022

Instituto Tecnológico de Chascomús (INTECH, CONICET-UNSAM)

El puyen, Galaxias maculatus, es el principal pez presa de los lagos Andinos. Sus poblaciones se encuentran sometidas tanto a los efectos de la introducción de salmónidos como al calentamiento global. La coexistencia con salmónidos puede traer aparejado un mayor grado de parasitismo, con consecuencias moduladoras sobre su sistema inmunitario. Además, por un lado, G. maculatus posee un amplio rango de distribución latitudinal en América del Sur, así como un amplio rango de distribución longitudinal circumpolar; y por otro lado, presenta diferentes historias de vida, con poblaciones de agua dulce y  diádromas. Estas características lo convierten en un excelente candidato tanto para el estudio de respuestas fisiológicas, como de adaptaciones locales a diferentes regímenes térmicos y de selección natural. Los estudios de eco-inmunología y eco-fisiología pueden abordarse mediante análisis de perfiles transcriptómicos, donde el éxito de estos depende de una correcta identificación de genes expresados. Por tal motivo, se propuso generar una base de datos genómica para G. maculatus que permita realizar una anotación correcta de genes en experimentos de transcriptómica, y al mismo tiempo brinde herramientas genómicas para estudios en biología evolutiva.Se presentan el ensamblado de novo del genoma de G. maculatus obtenido a partir de dos secuenciaciones de segunda generación: una biblioteca de fragmentos shotgun, y una biblioteca mate pairs de 8Kb, y el transcriptoma de novo con el fin de mejorar la anotación del genoma, a partir de la secuenciación RNAseq de 24 muestras de cuatro órganos: branquias, riñón anterior, hígado y cerebro.