Primer estudio de asociación del genoma completo en población argentina de la enfermedad de Alzheimer

DALMASSO, MC; LISSO, J; SEVILLANO, ZULMA; IRURETA, N; VILLELLA, I; MINTZ, I; MEDEL, N; SOLIS, P; KOCHEN, S

Jornada; 16° Jornadas Cientificas y de Gestión; 2023

Hospital El Cruce

INTRODUCCIONLos estudios de asociación del genoma completo (GWAS) identificaron varias regiones del genoma (loci) asociados a mayor riesgo de enfermedad de Alzheimer esporádica (EAE). A su vez, éstas variantes se utilizaron para el desarrollo de un índice de riesgo genético (IRG) que permite detectar la población con mayor riesgo de desarrollar la demencia. Sin embargo, estos hallazgos fueron obtenidos en población caucásica y necesitan ser validados en otras nuestra población.OBJETIVOSRealizar un estudio de GWAS en población ArgentinaEvaluar la asociación del IRG en nuestra población con la demencia tipo AlzheimerMETODOSSe reclutaron 1018 participantes de distintas regiones de Argentina (416 casos de EAE y 602 controles). Se genotipificaron a nivel de genoma completo (GSA v1.0, Illumina), se realizó un control de calidad estándar y se imputaron con el panel TOPMed. Se realizó una regresión logística ajustada por estratificación de la población. Se analizaron las variantes de riesgo de EAE previamente publicadas en nuestra población. Se estimó la ancestría de la población. Se estimó el IRG de los participantes y se evaluó su asociación con EAE. RESULTADOSRealizamos el primer estudio de GWAS de EAE en Sudamérica. La única variante genética que alcanzó significancia estadística fue APOE4, como era esperado dado el número de muestras. Replicamos varios loci de riego previamente publicados en nuestra población. Finalmente, observamos que el IRG en nuestra población se encuentra asociado a la EAE con un efecto similar al observado en europeos, sin embargo el valor del mismo disminuye a medida que aumenta la ascendencia amerindia de las muestras.CONCLUCIONESPresentamos el primer GWAS de enfermedad de Alzheimer en Sudamérica. El IRG creado en europeos funciona bien en nuestra población, sugiriendo que la genética en esta población mezcla con amerindios es similar. Sin embargo, el hecho de que los valores del mismo disminuyan a medida que aumenta la ascendencia amerindia, indica que hay variantes genéticas diversas aún por determinar.