Caracterización de α-amilasas identificadas en el genoma del lenguado negro (Paralichthys orbignyanus) mediante análisis bioinformáticos

ARMANI TOMAS; FERNANDO VILLARREAL; MECHALY ALEJANDRO

Chascomus

Simposio; VII Simposio Argentino de Ictiología; 2022

El lenguado negro, Paralichthys orbignyanus, es una especie de pez plano de importanciapesquera y con gran potencial en la acuicultura de Argentina, Brasil y Uruguay. Un aspectoclave para la mejora del cultivo de esta especie es obtener un mayor rendimiento en sucrecimiento, en ese sentido, las enzimas digestivas tienen un papel fundamental ya quecumplen un rol clave en la nutrición. Dada su importancia en el inicio de la degradación decarbohidratos complejos como el almidón, nos propusimos identificar y caracterizar losgenes correspondientes a α-amilasas en el genoma del lenguado negro. Para ello, seutilizaron herramientas de predicción de genes alimentadas con datos de secuencias degenes homólogos. Como resultado, se identificaron 2 copias de genes de amilasa (Po-amy2ay Po-amy2b) en tándem. Al igual que en otros peces, estas copias tienen una longitudaproximada de 512 aminoácidos. Para comprobar su correspondencia a dicha familiaanalizamos las secuencias en distintas bases de datos como InterPro y Pfam, donde seobservó que las enzimas predichas compartían la presencia de un péptido señal, residuoscatalíticos y de unión a calcio al igual que las α-amilasas previamente anotadas. Asimismo,mediante AlphaFold se resolvieron sus estructuras tridimensionales. En comparación conα-amilasas obtenidas mediante cristalografía en diferentes especies, los residuos catalíticosy de unión a calcio en Po-AMY2a y Po-AMY2b se encuentran bien conservadosestructuralmente. Los resultados obtenidos en este estudio podrían ayudar a optimizar elcultivo de esta especie desentrañando las bases de sus características digestivas y dealimentación.