Impacto de la acumulación de prácticas agrícolas intensivas convencionales sobre la microbiota bacteriana asociada al cultivo de tomate

VIO, SANTIAGO ADOLFO; MARTÍNEZ SBRANCIA, CARMEN; GORTARI, CECILIA; GALAR, MARÍA LINA; LUNA, MARIA FLAVIA

Bernal

Congreso; ISME Lat 2023; 2023

Universidad Nacional de Quilmes

Enla naturaleza y los agroecosistemas, las plantas conviven con complejascomunidades de microorganismos (fitomicrobiota, principalmente bacterias) quecolonizan distintos microhábitats, las cuales llevan a cabo funciones clavesque impactan en el crecimiento y la salud vegetal, y pueden verse modificadas pordiversos factores bióticos y abióticos.Eneste trabajo se caracterizó la microbiota bacteriana asociada al bulk de suelo, rizosfera y endosfera deraíz y tallo de plantas de tomate híbrido Elpida cultivadas bajocubierta en dos establecimientos comerciales del Cinturón Hortícola de La Plata(Argentina): Establecimiento-VN, un lote con amplio historial deproducción hortícola intensiva convencional y al menos 10 años de monocultivode tomate; y Establecimiento-M con un lote nunca antes cultivado(pastizal natural) y su primer cultivo de tomate. Por triplicado, se tomaronmuestras aleatorias de suelo, rizosfera (descalzando raíces y recogiendo elsuelo íntimamente adherido a éstas) y de plantas (raíz y tallo). Raíces ytallos se lavaron y desinfectaron superficialmente con NaClO (46 g/L) al 15%durante 30 minutos en agitación a 150 rpm para estudiar únicamente lascomunidades bacterianas endófitas. A partir de la extracción de ADN de lasdistintas muestras (FastDNA – MP-Biomedicals), se cuantificó el número decopias del gen ARNr 16S (qPCR – Primers:799F-1115R/Bac1369F-Prok1492R) y sesecuenció la región v3-v4 de dicho gen (Illumina-MySeq).Seencontró mayor abundancia poblacional (1013–1014 copiasARNr 16S g-1), mayor riqueza (Richness=1566-1835) ydiversidad de OTUs (Shannon-Wiener=6,4-6,7) en suelo-rizosfera respecto a raíz-tallo(108–1010 copias ARNr 16S g-1; Richness=251-597;Shannon-Wiener=2,8-4,4), independientemente del establecimiento. Proteobacteria fue el phylum másabundante (suelo-rizosfera~28-37%; raíz-tallo~50-85%), seguido en ordendecreciente por Bacteroidetes, Actinobacteria, Acidobacteria y Firmicutes.El análisis de beta diversidad agrupó las muestras en 2 clústeresdiferenciados por el microhábitat (p