Herramientas computacionales para el análisis de datos “ómicos” de células del sistema inmune individuales: foco en scRNAseq;TCRseq, ATACseq y citometría espectral

Fecha límite de inscripción

02-10-2023

Tema/resumen

Curso de capacitación en herramientas bioinformáticas para el análisis de datos obtenidos por ensayos de transcriptómica y proteómica de células inmunitarias individuales. Durante mucho tiempo, la caracterización de las células inmunitarias y sus microambientes se basó en tecnologías tradicionales basadas en el análisis de marcadores en poblaciones heterogéneas de un gran número de células. En la última década, la genómica y la proteómica unicelular han revolucionado la forma en que entendemos el sistema inmunitario y han permitido a los/as investigadores/as descubrir mecanismos biológicos nuevos e inesperados en relación con los métodos tradicionales de elaboración de perfiles que evalúan poblaciones en masa. Gracias al advenimiento de los enfoques genómicos/proteómicos unicelulares, las fronteras de la Inmunología se han extendido más allá de su papel convencional en la defensa contra patógenos, enfermedades autoinmunes, cáncer y trasplantes y comenzamos a comprender que la influencia del sistema inmunológico es asombrosamente vasta y alcanza a todos los tejidos y órganos. La secuenciación del ARN de una célula individual (scRNA-seq) puede revelar poblaciones de células complejas y raras, descubrir relaciones regulatorias entre genes y rastrear las trayectorias de distintos linajes celulares en desarrollo. Por otro lado, la citometría de flujo de alta dimensión (HD) ha permitido el análisis de una amplia gama de antígenos de superficie e intracelulares, al analizar un gran número de células y caracterizar poblaciones raras en función de múltiples parámetros. 

Este curso abordará los diferentes aspectos de tecnologías de vanguardia como scRNAseq/TCRseq, scATAQ sec y la citometría de flujo de alta dimensión y cómo éstas han impactado en la investigación inmunológica.

OBJETIVOS:

El objetivo de este curso es proporcionar a los y las estudiantes de posgrado y jóvenes investigadores/as de Argentina y otros países de América Latina los fundamentos de la transcriptómica y la proteómica unicelular. Durante este curso de 3 días, los y las asistentes aprenderán a utilizar métodos computacionales y estadísticos basados en R disponibles para el análisis de conjuntos de datos de células inmunitarias. 

CONTENIDOS MÍNIMOS:

Descripción general de la genómica unicelular, conceptos teóricos sobre cómo ejecutar un experimento scRNA/TCRseq, análisis bioinformático de transcriptómica de células individuales, conceptos generales sobre biología de células T y secuenciación de TCR en células individuales, herramientas e iniciativas públicas sobre genómica unicelular, introducción a la ATACseq de células individuales, citometría de flujo de alta dimensión.

Modalidad

Presencial

Para ver más detalles, haga click aquí.