La realización de la técnica inmunohistoquímica en tumores de mama, permite identificar y cuantificar marcadores proteicos presentes, y en base a ello elegir tratamientos personalizados. Los marcadores proteicos son Receptor de Estrógenos, Receptor de Progesterona, Receptor de Factor de crecimiento HER2- neu, y factor de proliferación KI-67.

Prestación 1: Cortes en Micrótomo del taco de parafina remitido, posterior tinción inmunohistoquímica del marcador o marcadores solicitados y su cuantificación. Prestación 2: Técnica de inmunohistoquímica para uno o más marcadores solicitados, sobre portaobjetos con cortes tumorales remitidos y su cuantificación.

Mediante Inmunohistoquímica, se realiza determinación de 4 marcadores: Receptor de Estrógenos, Receptor de Progesterona, Receptor de Factor de crecimiento HER2, y proteína asociada a proliferación KI-67. La técnica se realiza sobre portaobjetos con cortes del tumor mamario. Se procede a: - En caso de que la muestra remitida sea el taco de parafina, se provee servicio de cortes histológicos mediante micrótomo. - Desparafinización y rehidratación con xileno y gradiente de alcoholes; - Recuperación antigénica con buffer Citrato ph 6 o buffer TRIS-EDTA ph 9; - bloqueo de peroxidasas endógenas; - Reacción con anticuerpos primarios, kits aprobados para diagnóstico (IVD): Receptor de Estrógenos (monoclonal), Receptor de Progesterona (monoclonal), HER2-neu (monoclonal), KI-67 (monoclonal). - Reacción con anticuerpos secundarios unidos a peroxidasa. - Revelado con DAB, diaminobencidina. - Deshidratación con gradiente de alcoholes y xileno - Montaje con aceite y cubreobjetos. - Se cuantifican los marcadores teñidos bajo microscopia óptica y se remiten esos resultados al solicitante, pudiendo remitirse los portaobjetos coloreados de ser necesario.

Micrótomo Leica FM2245 | Microscopio Carl Zeiss PRIMO STAR

Bioquímica y Biología Molecular

MEDICINA-PATOLOGIA

Prestaciones sanitarias-Otros

Servicios de prácticas de diagnóstico en laboratorios (Incluye análisis clínicos, bioquímica, anatomía patológica, laboratorio hematológico, etc.)

INMUNOHISTOQUIMICA
TUMOR DE MAMA
RECEPTORES DE ESTROGENO Y PROGESTERONA
KI-67
HER2-neu

Detección del genoma del virus SARS-COV-2 en muestras del tracto respiratorio alto o bajo.

Extracción de ARN y deteccion de genoma del virus SARS-COV-2 por RT-qPCR, en hisopados orofaringeo y nasofaríngeo, aspirado traqueal, o lavados broncoalveolares.

Las muestras se procesan para la extracción del ARN total en Cabina de Bioseguridad II, mediante el uso de columnas de extracción comerciales. Una vez extraido, el mismo se somete a retrotranscripción (RT) y seguida amplificación por PCR en tiempo real, de los genes N1 y N2 (propios de SARS-COV-2), y de un gen interno control (propio de las células humanas tomadas en la muestra). Periódicamente se registran validaciones de la técnica según estándares establecidos. Se informan los resultados a los solicitantes. Se informarán los resultados de la determinación a la institución de salud solicitante de la prestación y es esta quien realiza la interpretación clínica de los mismos.

Cabina de flujo laminar Esco SC2-4A1 | Termociclador Bio-Rad CFX96

Ciencias Médicas

BIOLOGIA-OTRAS

Salud humana

Servicios de prácticas de diagnóstico en laboratorios (Incluye análisis clínicos, bioquímica, anatomía patológica, laboratorio hematológico, etc.)

SARS-CoV-2
PCR REAL TIME
DETECCION

Se realiza la evaluación de trabajos científicos sobre geohidrología desde el punto de vista del contenido de los mismos y de las normas editoriales correspondientes. Dirigido a revistas y editoriales nacionales e internacionales.

Para llevar a cabo estas tareas es necesaria la lectura de los artículos, revisión de bibliografía citada, comparación de los resultados obtenidos con otras publicaciones mencionadas en el manuscrito y calificación de la calidad de las figuras. Adicionalmente se evaluará si la presentación cumple con las normas editoriales. Se presentará un informe con las correcciones pertinentes así como el mismo manuscrito acompañado de comentarios relativos a las correcciones a efectuar.

Ciencias de la Tierra,del Agua y de la Atmósfera

CIENCIAS EXACTAS Y NATURALES

Recursos hidricos

Ensayos y análisis técnicos

Evaluación
Revisión

Análisis de la situación de interés y selección del método geofísico más adecuado para su resolución .Trabajos de campo y gabinete involucrados en una prospección con métodos geofísicos.

Logística y traslado hasta la zona de estudio, adquisición y control de calidad de datos geofísicos. Procesamiento de datos y elaboración de informe técnico. La adquisición de datos geofísicos involucra la utilización de equipamiento específico: sonda electromagnética y georradar (electromagnetismo), resistivímetro de corriente conmutada y polarización inducida (geoeléctrica) y sismógrafo (método sísmico). Cada dato es corroborado en campo para que satisfaga los controles de calidad específicos. Luego se procesan con software específico y se elabora un modelo geofísico, dependiendo de la técnica utilizada. Por último, se realiza un informe técnico detallando la metodología utilizada, los resultados obtenidos y las recomendaciones o conclusiones.

Sonda electromagnética Generico Explorer | Resistivímetro corriente conmutada Generico ARES II | Georradar Generico SIR 3000 | Geode Geometrics Geode de 24 canales

Ciencias de la Tierra,del Agua y de la Atmósfera

CIENCIAS DE LA TIERRA-GEOFISICA

Recursos hidricos

Actividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.

Geofísica
Geoeléctrica
Sísmica
EM
GPR

1: La detección de Clostridioides difficile por el método rápido de EIA permite identificar el antígeno GDH simultáneamente a las toxinas A y B, discriminando entre cepas toxigénicas y no toxigénicas. 2: El ChromAgar C. difficile es un medio de cultivo solido específico para C. difficile. Esto permite detectar la presencia de la bacteria en muestras de materia fecal, luego se realiza PCR de punto final para determinar la presencia de toxina B mediante la utilización de cebadores específicos

1- Toma de alícuota de materia fecal, resuspención en buffer para sembrado de muestra en casete de EIA y detección del resultado. 2- Preparación del medio de cultivo ChromAgar, sembrado de muestra de materia fecal en placas de Petri con el medio sólido, detección de colonias de Clostridioides difficile. Posteriormente, se realiza extracción de DNA a partir de las colonias y se detecta el gen de la Toxina B por PCR de punto final.

: Prestación 1- Recolección de la muestra de materia fecal con el dispositivo provisto por el Kit, homogenización mediante vortex con el Buffer comercial, sembrado por goteo en los pocillos del casette de EIA, luego de 10 minutos se lee el resultado. Prestación 2- Preparación de medio solido CHROMAgar en placas de Petri, dilución de la muestra de materia fecal en PBS1X estéril, sembrado de la muestra diluida en las placas de Petri con medio específico ChromAgar C. difficile, identificación y aislamiento de colonias de C. difficile por fluorescencia con luz UV. Extracción de DNA mediante Boilling a 95°C por 10 minutos, preparado de Master Mix para PCR punto final con dNTP´s, primers específicos para Toxina B y Taq Polimerasa (T-Holmes, Inbio Highway). Ciclado de temperaturas. Detección de amplicones de Toxina B en gel de agarosa teñidos con intercalante de DNA SyBR Safe.

Transiluminador Safe Imager 2.0 blue-light transilluminator Invitrogen Safe Imager 2.0 blue-light transilluminator | Agitador Thermo Scientific MaxQ 4450 Thermo Scientific MaxQ4450 | Termociclador Veriti de 96 pocillos Applied Biosystem Veriti 96 wells | Cuba Wide Mini-Sub Cell GT Cell Bio-Rad Wide Mini-Sub Cell GT Cell

Ciencias Médicas

MEDICINA-BACTERIOLOGIA

Prestaciones sanitarias-Otros

Servicios de prácticas de diagnóstico en laboratorios (Incluye análisis clínicos, bioquímica, anatomía patológica, laboratorio hematológico, etc.)

Clostridioides difficile
Toxina B
Infección bacteriana
diarrea
Antibióticos- Disbiosis

Capacitación teórica y práctica sobre la aplicación de técnicas geofísicas.

Se brindan herramientas teóricas y prácticas a profesionales interesados en desarrollar capacidades para aplicar los métodos de prospección geofísicas para brindar soluciones a problemas específicos. Temas: Geofísica. Métodos de prospección geofísicas. Fortalezas y debilidades de cada método. Adquisición, procesamiento e interpretación de datos. Casos de estudio.

El servicio consta de clases teóricas, prácticas y talleres que se pueden dictar en modalidad presencial o virtual. Está destinado a profesionales interesados en la utilización de técnicas geofísicas para resolver situaciones concretas, especialmente de las áreas de investigaciones forenses, arqueología, geología, agronomía e ingeniería.

Ciencias de la Tierra,del Agua y de la Atmósfera

CIENCIAS DE LA TIERRA-GEOQUIMICA

Ciencia y cultura-Ciencia y tecnologia

Servicios de enseñanza n.c.p. (Incluye instrucción impartida mediante programas de radio, televisión, correspondencia y otros medios de comunicación, escuelas de manejo, actividades de enseñanza a domicilio y/o particulares, etc.)

Geofísica
Geoeléctrica
Sísmica
EM
GPR

La realización de la técnica inmunohistoquímica en tumor de pulmón, permite identificar marcadores proteicos que diferencian los principales subtipos tumorales (adenocarcinoma y carcinoma de células escamosas) y clasificar el mismo, y en base a ello decidir el tratamiento personalizado. Los marcadores proteicos son Factor de Transcripcion tiroidea TTF-1, y p40 que es la región N-terminal de isoforma deltaNp63 de la proteína p63.

Prestación 1: Cortes en Micrótomo del taco de parafina remitido. Prestación 2: Técnica de inmunohistoquímica para el marcador TTF1, sobre portaobjetos con cortes tumorales remitidos y su identificación. Prestación 3: Técnica de inmunohistoquímica para p40, sobre portaobjetos con cortes tumorales remitidos y su identificación.

Mediante Inmunohistoquímica, se realiza determinación de 2 marcadores: son Factor de Transcripcion tiroidea TTF-1, y p40. La técnica se realiza sobre portaobjetos con cortes del tumor pulmonar. Se procede a: - En caso de que la muestra remitida sea el taco de parafina, se provee servicio de cortes histológicos mediante micrótomo. - Desparafinización y rehidratación con xileno y gradiente de alcoholes; - Recuperación antigénica con buffer Citrato ph 6 o buffer TRIS-EDTA ph 9; - bloqueo de peroxidasas endógenas; - Reacción con anticuerpos primarios, kits aprobados para diagnóstico (IVD): son Anti Factor de Transcripcion tiroidea TTF-1 (monoclonal), y Anti p40 (monoclonal). - Reacción con anticuerpos secundarios unidos a peroxidasa. - Revelado con DAB, diaminobencidina. - Deshidratación con gradiente de alcoholes y xileno - Montaje con aceite y cubreobjetos. - Se identifican los marcadores teñidos bajo microscopia óptica y se remiten esos resultados al solicitante, pudiendo remitirse los portaobjetos coloreados de ser necesario.

Microscopio Carl Zeiss Primo Star | Microtómo Leica FM2245

Bioquímica y Biología Molecular

MEDICINA-PATOLOGIA

Prestaciones sanitarias-Otros

Servicios de prácticas de diagnóstico en laboratorios (Incluye análisis clínicos, bioquímica, anatomía patológica, laboratorio hematológico, etc.)

Inmunohistoquimica
Tumor de pulmón
TTF1
p40

La realización de la técnica inmunohistoquímica en tejido de próstata, permite identificar marcadores proteicos que direccionan la clasificación de hiperplasias benignas o malignas, y en base a ello llegar a un diagnóstico certero. Los marcadores proteicos son Citoqueratina 903, y la enzima alfa-metilacil-CoA racemasa.

Prestación 1: Cortes en Micrótomo del taco de parafina remitido. PRESTACION 2: Técnica de inmunohistoquímica para Citoqueratina 903 sobre portaobjetos con cortes de tejido prostático y su identificación. PRESTACION 3: Técnica de inmunohistoquímica para para racemasa sobre portaobjetos con cortes de tejido prostático y su identificación.

Mediante Inmunohistoquímica, se realiza determinación de 2 marcadores: son Citoqueratina 903, y Racemasa. La técnica se realiza sobre portaobjetos con cortes de tejido prostático. Se procede a: - En caso de que la muestra remitida sea el taco de parafina, se provee servicio de cortes histológicos mediante micrótomo. - Desparafinización y rehidratación con xileno y gradiente de alcoholes; - Recuperación antigénica con buffer Citrato ph 6 o buffer TRIS-EDTA ph 9; - bloqueo de peroxidasas endógenas; - Reacción con anticuerpos primarios, kits aprobados para diagnóstico (IVD): son AntiCitoqueratina 903 (monoclonal), y AntiRacesama (monoclonal). - Reacción con anticuerpos secundarios unidos a peroxidasa. - Revelado con DAB, diaminobencidina. - Deshidratación con gradiente de alcoholes y xileno - Montaje con aceite y cubreobjetos. - Se identifican los marcadores teñidos bajo microscopia óptica y se remiten esos resultados al solicitante, quien se encargara de la interpretación de los mismos, pudiendo remitirse los portaobjetos coloreados de ser requerido.

Microscopio óptico Carl Zeiss Primo Star

Bioquímica y Biología Molecular

MEDICINA-PATOLOGIA

Prestaciones sanitarias-Otros

Servicios de prácticas de diagnóstico en laboratorios (Incluye análisis clínicos, bioquímica, anatomía patológica, laboratorio hematológico, etc.)

Inmunohistoquimica
Prostata
Citoqueratina 903
Racemasa

Capacitación teórica y práctica - Bases ecofisiológicas del rendimiento y la calidad en cereales invernales 2) Capacitación en el análisis e integración de variables de manejo y climáticas para comprender la variación de rendimiento y la calidad.

Involucra conceptos de ecofisiología sobre generación de rendimiento potencial, limitado por agua y real. También considera la determinación de calidad comercial e industrial. La parte práctica involucra metodologías de muestreo a campo. Considera el procesamiento de datos e interpretación de resultados de rendimiento y calidad según variables de manejo y climáticas

Ciencias Agrarias

AGRONOMIA Y DASONOMIA-FITOTECNIA

Produccion vegetal-Cereales

Actividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.

ECOFISIOLOGIA-CEREALES
MANEJO -RENDIMIENTO
PRODUCCION-CALIDAD

Se prestarán servicios de consultoría científico- técnica a empresas/ entidades privadas o públicas que lo requieran, para la definición de técnicas de caracterización e identificación de biomoléculas de interés biotecnológico producidos a partir de cultivos in vitro vegetales ya establecidos.

Revisión de publicaciones científicas, protocolos y patentes tecnológicas publicadas referentes a la caracterización e identificación de biomoléculas de interés biotecnológico a partir de cultivos in vitro vegetales. Dado el estado de situación del cultivo in vitro vegetal se determinará desde un punto de vista científico-teórico las técnicas acordes a fin de caracterizar y/o identificar un determinado producto o grupo de productos con interés biotecnológico. No se contempla el uso de equipamiento de laboratorio ni de reactivos. Se entregará un informe con las técnicas de caracterización e identificación recomendadas, el cual no reviste carácter de certificación.

Ingeniería de Procesos

BIOLOGIA

Produccion vegetal-Otros

Actividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.

CULTIVOS
IN VITRO
VEGETALES
ASESORAMIENTO
IDENTIFICACIÓN DE PRODUCTOS

P1) Detección de patógenos (virus, bacterias y fitoplasmas) en cultivos e insectos hemípteros mediante las técnicas moleculares de PCR y RT-PCR. P2) Detección y cuantificación de patógenos (virus, bacterias y fitoplasmas) en cultivos e insectos hemípteros mediante qPCR y qRT-PCR Ambas prestaciones se ofrecerán a empresas/entidades públicas y privadas del sector agropecuario.

P1) Extracción de ácidos nucleicos y amplificación de fragmentos de ADN de interés, utilizando como material de partida ADN total o ADN derivado de ARN total de plantas y/o insectos, para la detección de patógenos. P2) Extracción de ácidos nucleicos y amplificación de fragmentos de ADN de interés, utilizando como material de partida ADN total o ADN derivado de ARN total de plantas y/o insectos, para la detección y cuantificación de patógenos.

Las muestras serán colectadas y almacenadas según su origen. Las hojas de los cultivos se colectarán preferentemente en bolsas de plástico, mientras que los insectos (individualizados o en grupos) serán enviados en tubos de microcentrífuga. Se enviarán en frío, y si se utiliza ARN, se deberá prever la conservación su integridad. La extracción de ácidos nucleicos se realiza de acuerdo al tipo de material de partida, siguiendo el protocolo establecido acorde al método CTAB (Doyle & Doyle 1990) o utilizando el reactivo Trizol (Invitrogen). La cuantificación del material extraído se evaluará mediante el fluorímetro Qubit, la integridad del mismo se analizará mediante electroforesis en gel de agarosa. P1) Posteriormente, se realizará la amplificación de los fragmentos de interés mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Los amplicones obtenidos se visualizarán mediante electroforesis en gel de agarosa 1-2%. P2) A continuación, se realizará la amplificación de los fragmentos de interés mediante PCR cuantitativa. Los datos de las reacciones se recopilarán a través del software CFX Manager 3.0. Ambas prestaciones reportarán los resultados obtenidos mediante informe escrito respondiendo a los objetivos planteados por el solicitante.

TRANSILUMINADOR INGENIUS 3 Synergy INGENIUS 3 | Bloque seco complementario AERO DYCA AERIS BG-096 | Centrífuga Refrigerada Heal Force Neofuge 13 R | CFX Real Time System Bio-Rad CFX Real Time System | Centrífuga de placas Numak 2 2208413

Ciencias Agrarias

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y VETERINARIAS

Sanidad vegetal-Plagas

Investigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias agropecuarias

Insectos vectores
Bacterias
Virus
Maíz
Soja

1- Determ. de polifenoles totales utilizando el método de Folin-Ciocalteu. 2- Determ. de activ. antioxid., método bioq. basado ABTS. 3- Determ. de activ. antioxid., método bioq. basado en DPPH. 4- Determ. de activ. antioxid., método bioq. basado en FRAP. Se prestarán a empresas/entidades privadas o públicas que requieran estas mediciones en diferentes extractos de origen natural para diferentes aplicaciones biotecnológicas en las áreas de cosmética, nutracéutica, farmaceútica, alimenticia, etc.

El extracto natural es molido en mortero y se realiza una extracción de metabolitos utilizando determinados solventes orgánicos con agitación suave en oscuridad y a temperatura ambiente. Los sobrenadantes de extracción se separan de los extractos mediante centrifugación a 10.000 x g y se guardan en oscuridad a -20°C hasta su procesamiento por los métodos bioquímicos correspondientes.

El solicitante enviará los extractos naturales a analizar secos o liofilizados y protegidos de la oscuridad, se les realizarán las extracciones de metabolitos pertinentes y se procederá a realizar las prestaciones solicitadas. P1-. Este reactivo contiene una mezcla de wolframato sódico y molibdato sódico en ácido fosfórico y reacciona con compuestos fenólicos pudiendo cuantificarlos espectrofotométricamente en 765 nm. Los resultados se comparan con una curva de calibración de un polifenol de concentración conocida (por ejemplo, ác. gálico). P2-. El reactivo ABTS (2,2?-acino-bis(3-etilbenzotiazolina-6-sulfónico) sal de diamonio) es oxidado en presencia de K2S2O8 generando el radical catiónico ABTS*. En presencia de un antioxidante el ABTS* vuelve a su estado inicial reducido, pudiendo cuantificarlo espectrofotométricamente en 734 nm. La cantidad de activ. antioxidante es comparada respecto a una curva de calibración utilizando 6-hydroxy-2,5,7,8-tetramethylchroman-2-carboxylic acid. P3-. El método de DPPH (1,1-difenil-2-picrilhidrazina) consiste en un método de captación de radicales libres. Su fundamento se basa en la aceptación de un electrón o átomo de hidrógeno por la molécula de DPPH. Estos cambios se determinan espectrofotométricamente en 517 nm. Se determina la concentración/ dilución de la muestra que registra una caída en un 50% de la capacidad antioxidante respecto a la absorbancia control. P4-. Este método consiste en la reducción de una solución que contiene FeCl3·6H2O, y 2,4,6-Tris(2-pyridyl)-S-triazina, pH 3.6, que se pueden determinar espectrofotométricamente en 593 nm. La capacidad antioxidante de la muestra incógnita es comparada con una curva de calibración usando FeSO4·7H2O. Con los resultados obtenidos se elaborará un informe con los métodos bioquímicos aplicados y sus citas bibliográficas correspondientes. El mismo no revistirá carácter de certificación.

Espectrofotómetro MAPADA. UV-6100PC double beam. Madeva UV-6100PC doublé beam | Centrífuga. NeoFuge 13. Heal Force NeoFuge 13 | Agitador tipo Rocking o de vaivén DLAB SK-R330-Pro

Ingeniería de Procesos

QUIMICA

Produccion vegetal-Otros

Actividades profesionales, científicas y técnicas n.c.p.

POLIFENOLES TOTALES
ACTIVIDAD ANTIOXIDANTE
CARACTERIZACIÓN DE PRODUCTOS
METABOLITOS SECUNDARIOS

El servicio será brindado a empresas públicas y privadas, instituciones de investigación científica y educativas. El servicio consta de 3 prestaciones. Con la recepción de muestras y de reactivos de marcación (compatibles con el equipo), se procede a la preparación y adquisición en Citómetro de Flujo. Los datos se exportan en formato FCS 2.0 o 3.0 para su posterior análisis por el solicitante, o se entrega análisis incluyendo gráficos y estadística de datos en caso de ser solicitado.

P1: Preparación de muestras y protocolos de marcación para determinaciones por citometría. P2: Adquisición de muestras en suspensión, visualización de resultados y exportación de los mismos en formato FCs 2.0 o 3.0. P3: Análisis de resultados e informe.

P1: Se realizan los pasos necesarios según protocolos establecidos para la adquisición. Los reactivos específicos (anticuerpos, fluoróforos, sondas) son provistos por el solicitante. Se incluyen insumos generales. P2: Adquisición de muestras en suspensión, visualización de resultados y exportación en formato FCs 2.0 o 3.0 para su posterior análisis a cargo del solicitante. P3: Análisis de resultados y elaboración de informe con gráficos y estadística de datos. De ser solicitado, se entregarán los datos exportados en FCS 2.0 o 3.0. el informe no reviste carácter de certificación.

Citometro de flujo Becton Dickinson FacsCanto II | Centrífuga refrigerada Thermo Fisher Sorvall ST16R Cat. 75004380

Biología

BIOLOGIA-CELULAR Y MOLECULAR

Salud humana

Investigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias médicas

Citometría de flujos
CITOMETRÍA DE FLUJO
Inmunomarcación
INMUNOMARCACIÓN

Asesoramiento a empresas públicas y privadas sobre Citometría de Flujo. Esquemas de marcación, exploración de diferentes aplicaciones (cuantific. de microorg., cuantific. y caracterización de poblaciones celulares, viabilidad, pureza de muestras, muerte celular, ciclo celular, etc)teniendo en cuenta las caract. del Citómetro. Incluye la búsq. de reactivos, comb. de fluoróforos según caract. del equipo, entre otros. Se ofrece informe en PDF. Asesoram. virtual. El informe no refiere certificación.

Asesoramiento para determinaciones por citometría de flujo, protocolos según aplicaciones solicitadas. Incluye la búsqueda de reactivos, combinaciones de fluoróforos según las características ópticas del equipo, entre otros. Finalmente se ofrece un informe final en formato PDF del servicio. Este asesoramiento se realiza de manera virtual.

Biología

BIOLOGIA-CELULAR Y MOLECULAR

Salud humana

Investigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias médicas

Citometría de flujos
Inmunomarcación

P1: Extracción de ADN y RNA para análisis genético/transcriptómicos. P2: Realización de análisis bioinformático cualitativo y cuantitativo a partir de los datos crudos generados por la secuenciación. El servicio está dirigido a empresas y centros de investigación públicos y privados.

P1: preparación de muestras para secuenciación de experimentos de RNAseq. Toma de muestras, almacenamiento, extracción de ADN y/o ARN, chequeo de integridad y cuantificación para su posterior secuenciación tercearizada. P2: Análisis Bioinformatico de datos de secuenciación, análisis cualitativos de profundidad de secuenciación, cobertura de secuenciación, búsqueda de ortólogos, asignación de términos GO, adquisición de datos cuantitativos comparando replicas biológicas y diferentes tratamientos

Las muestras serán colectadas y almacenadas según su origen. Una vez inventariadas, se las almacenará en frío. Si se utiliza ARN, se proveerá la conservación de este para garantizar su integridad almacenando las mismas e RNALater (Invitrogen). La extracción de ácidos nucleicos se realiza de acuerdo con el tipo de material de partida, siguiendo el protocolo establecido para la extracción de ARN el reactivo Trizol (Invitrogen). La cuantificación del material extraído se evaluará mediante el fluorometro Qubit (Invitrogen), la integridad de este se analizará mediante electroforesis en gel de agarosa. Las muestras serán enviadas a secuenciar evaluando previamente la estrategia de secuenciación según las necesidades del contratante y el experimento realizado. Los datos crudos generados por el proceso de secuenciación (ShotGun sequencing) se descargan a nuestro servidor. El control de calidad de los datos de secuenciación (archivos Fastq) se realizará a través de herramientas como FASTX-Toolkit y FASTQC. Las lecturas filtradas luego se alinearán y/o mapearon a las secuencias del genoma de referencia para realizar ensamblados de transcriptomas y/o genomas y su ulterior análisis cualitativo o cuantitativo y cuantitativo. Al finalizar se entregará un informe de resultados.

TRANSILUMINADOR INGENIUS 3 Synergy INGENIUS 3 | Bloque seco complementario AERO DYCA AERIS BG-096 | Centrífuga Refrigerada Heal Force Neofuge 13 R | Centrífuga de placas Numak 2 2208413

Biología

BIOLOGIA-CELULAR Y MOLECULAR

Salud humana

Investigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias exactas y naturales n.c.p.

Transcriptómica
Bioinformática
Secuenciación
Shotgun sequencing

Capacitación y asesoramiento en biología del vector y los patógenos y dinámica de la enfermedad, sintomatología, transmisión de patógenos.

Características de la alimentación, transmisión de patógenos, reconocimiento de Dalbulus maidis, identificación de machos y hembras, identificación de los diferentes estadios ninfales, identificación de posturas. Manejo de los insectos: caja negra, aspiradores. Condiciones para la cría. Distintas formas de jaulas. Pautas para la cría de insectos sanos. Pautas para la cría de insectos inoculativos. Patógenos, formas de transmisión. Sintomatología de la enfermedad.

Ciencias Agrarias

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y VETERINARIAS

Sanidad vegetal-Plagas

Investigación y desarrollo experimental en el campo de las ciencias agropecuarias

Dalbulus maidis
Achaparramiento
Spiroplama kunkelii
Fitoplasma
Virus del rayado fino