INVESTIGADORES
LOZADA mariana
congresos y reuniones científicas
Título:
Metagenómica de sedimentos costeros polares y subpolares de ambos hemisferios: una visión global del potencial metabólico de las comunidades microbianas de ambientes fríos
Autor/es:
ESPÍNOLA, FERNANDO; DIONISI, HEBE; LOZADA, MARIANA
Lugar:
Puerto Madryn
Reunión:
Jornada; 6ta Jornada de Becarios; 2016
Institución organizadora:
Espacio Becarios CENPAT-CONICET
Resumen:
p { margin-bottom: 0.25cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 120%; }p.western { font-family: "Liberation Serif","Times New Roman",serif; font-size: 12pt; }p.cjk { font-family: "Droid Sans Fallback"; font-size: 12pt; }p.ctl { font-family: "FreeSans"; font-size: 12pt; }a:link { }Los microorganismos ambientalesparticipan en numerosos procesos fundamentales para la regulación yfuncionamiento de los ecosistemas, tales como el ciclado denutrientes y la biodegradación de contaminantes. La exploración delpotencial metabólico de las comunidades microbianas y su relacióncon las características del ambiente brinda información esencialpara la comprensión de los servicios ecosistémicos que las mismasestarían proveyendo, así como de los factores que podríancontribuir a su estructuración. El objetivo del presente trabajofue caracterizar el potencial metabólico del metagenoma de lascomunidades microbianas de sedimentos costeros de zonas frías yanalizar su relación con variables ambientales. Para ello seanalizaron porsecuenciación al azar en gran escala (Illumina HiSeq2000)ADN de 23 muestras de sedimentos submareales crónicamentecontaminados con hidrocarburos de ambos hemisferios(Archipiélago Svalbard, Noruega; Mar Báltico, Suecia; BahíaUshuaia, Argentina y Caleta Potter, Antártida).Luegodel ensamblado y anotación (IMG/M,http://img.jgi.doe.gov/m/),los datos se analizaron por métodos bionformáticosy estadísticos (R,www.r-project.org).A nivel de categorías metabólicas generales (sistema KEGG,http://www.genome.jp/kegg/pathway.html),las comunidades presentaron un perfil funcional similar. En nivelesmás finos (módulos del sistema KEGG), sin embargo, se observó unaestructuración en función de la salinidad y temperaturaprincipalmente. Engeneral, losgenes para la biodegradación anaeróbica de hidrocarburos seencontraron en igual o mayor proporción que los aeróbicos. Ademáslos genes ndoy bssA(codificantesde la subunidad catalítica de la enzima naftaleno dioxigenasa ybencilsuccinato sintasa respectivamente) mostraron correlacionessignificativas con el contenido de hidrocarburos. Estos resultadospermitieron identificar un potencial metabólico convergente en lascomunidades analizadas, destacando diferencias a niveles finos deanálisis, en un contexto de contaminación crónica conhidrocarburos en ambientes fríos.