Interacciones no-covalentes nucleotido-fotosensibilizador usando metodos semiempiricos

CARLOS A. FRANCA; REYNALDO PIS DIEZ; MARIA MICAELA GONZALEZ; FRANCO M. CABRERIZO; MARTIN LAVECCHIA

Natal

Congreso; XXXVIII Congreso de Quimicos Teoricos de Expresion Latina; 2012

Asociacion Internacional de Quimicos Teoricos de Expresion Latina

Las interacciones no covalentes son de fundamental importancia para explorar estructuras moleculares en sistemas biológicos. La descripción teórica de tales interacciones es compleja, principalmente porque estas son mucho más débiles que las interacciones covalentes y, además, por el rol que juegan se deben tener en cuenta las energías de dispersión de London. Pavel Hobza y colaboradores introdujeron una extensión al método semiempírico PM6 con el objeto de incluir estas interacciones. En este trabajo utilizamos este método con corrección por dispersión y puente de hidrógeno (PM6-DH+) para estudiar los complejos formados entre la molécula del fotosensibilizador norharmano y el nucleótido deoxiadenosinmonofosfato (dAMP) a diferentes valores de pH. Esto es relevante ya que los fotosensibilizadores son compuestos capaces de absorber radiación UV y mediar entre esta y el ADN para provocar daño celular. A través de una búsqueda conformacional usando algoritmos genéticos obtuvimos 404, 325 y 343 confórmeros de partida para los sistemas a pHs 2.5, 5.4 y 10.5, respectivamente, y optimizamos sus geometrías al nivel de teoría PM6-DH+. Los calores de formación calculados están de acuerdo con las constantes de formación halladas experimentalmente (valores propios aun no publicados). Además, se observaron en las geometrías halladas las interacciones pi-stacking propias de estos sistemas, y se caracterizaron las uniones de tipo puente de hidrogeno para los mismos.