Identification of genes involved in the apomictic reproduction of Eragrostis curvula using cDNA libraries

JOSÉ ROMERO; DÍAZ M,; PANIEGO N,; JUAN P. SELVA; VIVIANA ECHENIQUE

Chillán

Conferencia; 1st International Conference on Bioinformatics SoIBio 2010; 2010

Asociación Latinoamerica de Bioinformatica

La apomixis es un tipo de reproducción asexual con formación de semillas fuertemente ligada a la poliploidía. Eragrostis curvula es una forrajera de amplia distribución en la zona semiárida de la Argentina y presenta un amplio rango de variación en el nivel de ploidía (2x-8x), existiendo tanto genotipos sexuales como apomícticos.   El objetivo de este trabajo fue la identificación de genes potencialmente involucrados en la determinación del modo reproductivo mediante la comparación de dos técnicas de análisis de la expresión de genes, genotecas de ADNc y display diferencial. Se compararon in silico 4 genotecas de ADNc construidas e informadas previamente por nuestro grupo de trabajo, entre sí y con los análisis de display diferencial. Se analizaron 12.295 ESTs provenientes de inflorescencias y hojas de plantas de diferentes modos reproductivos y niveles de ploidía. Se identificaron genes con expresión diferencial por modo reproductivo, nivel de ploidía y tipo de tejido. Se puso énfasis en las secuencias de retrotransposones conocidos o potenciales. También se consideraron aspectos epigenéticos en la expresión del modo reproductivo utilizando la técnica de MSAP  y se buscaron en las genotecas secuencias relacionadas a mecanismos de silenciamiento genético. Se observó expresión diferencial de genes en todas las comparaciones realizadas. En algunos casos fueron coincidentes con lo observado por display diferencial y con lo informado previamente para otras especies apomícticas. Se observó la presencia de elementos móviles activos en las 4 genotecas estudiadas, siendo significativamente menor su número en el genotipo apomíctico. Lo informado en este trabajo refuerza lo observado previamente en otras especies y aporta nuevos elementos para la dilucidación del modo reproductivo en E. curvula.