Polimorfismos de amplificación de secuencias relacionadas (SRAP): su aplicación para el estudio de variabilidad genética de Fusarium poae

DINOLFO M.I.; STENGLEIN S. A.

Ciudad Autónoma de Buenos Aires

Congreso; XI Congreso Latinoamericano de Microbiología e Higiene de los Alimentos. IV Congreso Argentino de Microbiología de los Alimentos.III Simposio Argentino de Conservación de Alimentos; 2012

La fusariosis de la espiga es una enfermedad comúnmente asociada a la presencia de hongos del género Fusarium, que pueden afectar especialmente a los cereales y causar pérdidas tanto cualitativas como cuantitativas en los granos. Una de las especies causales de esta enfermedad es Fusarium poae, cuya predominancia en los últimos años se ha visto incrementada. Esta especie reviste especial importancia debido a su capacidad de producir diversos tipos de micotoxinas cuyos efectos adversos en la salud de los consumidores, tanto humanos como animales, han sido estudiados. El objetivo del presente trabajo fue analizar la variabilidad genética, mediante la técnica de SRAP, utilizando 106 aislamientos monospóricos de Fusarium poae provenientes de la Argentina, Inglaterra, Finlandia, Suiza, Polonia, Alemania, Canadá, Francia, Hungría y Uruguay, a los cuales se le adicionó un aislamiento de F. sporotrichioides utilizado como grupo externo. Se utilizaron 8 combinaciones diferentes de cebadores, cuyas amplificaciones fueron corridas en geles verticales de poliacrilamida y reveladas mediante tinción con plata. Los patrones de amplificación revelaron un total de 117 bandas, de las cuales se analizó presencia-ausencia para el total de los aislamientos, se realizó un análisis de agrupamiento y un análisis molecular de la varianza (AMOVA) para el cual se separaron los aislamientos de acuerdo a su continente originario, obteniéndose un grupo americano y otro europeo. La similitud entre genotipos se cuantificó mediante el uso de tres coeficientes de asociación, de los cuales se seleccionó el índice de Simple Matching por mostrar el menor grado de distorsión. El análisis del fenograma diferenció 105 haplotipos del total de los aislamientos analizados, sin mostrar un agrupamiento definido a su origen y/o a su hospedante. La variabilidad de la población se estimó en 0.998 lo que determina que la mayoría de los genotipos (99,98) de F. poae son diferentes. Los resultados del AMOVA arrojaron un 9,17% de diferencias entre grupos y un 90,83% dentro de grupos. De acuerdo a los resultados obtenidos, se puede observar que la técnica de SRAP es adecuada para estudiar la variabilidad genética presente en los aislamientos de F. poae. Pese a que la especie no cuenta con una reproducción sexual conocida, la presencia de fragmentos polimórficos pondría en evidencia la existencia de diversos mecanismos generadores de variabilidad.