Nuevas herramientas de diseño biomolecular y su aplicación en sistemas de interés terapéutico

CINTIA A. MENÉNDEZ; SEBASTIÁN R. ACCORDINO; DARÍO C. GERBINO; GUSTAVO A. APPIGNANESI

Villa de Merlo

Congreso; 100 Reunion Nacional de la Asociacion Fsica Argentina; 2015

Asociación Física Argentina

En este trabajo estudiamos, por medio de matrices de contacto en proteínas, la existencia de puentes de hidrogeno del backbone (BHBs) cuya persistencia en el tiempo diere signicativamente del estado de dicha interaccion en el correspondiente PDB de la proteína. Apodamos a estas interacciones como BHBs camaleonicos (CBHBs), precisamente por su contribucion al cambio de la prescripcion estructural del PDB. Tambien encontramos un enriquecimiento signicativo en CBHBs en los sitios de binding de diversas protenas de interes terapeutico, vinculando as a estas interacciones con aquellas regiones en protenas expuestas al agua de hidratacion. Es por esto que resulta interesante estudiar el comportamiento de los CBHBs como potenciales sitios blanco de ligandos y drogas. De esta manera mostramos que el estudio dinamico de los BHBs en protenas es una herramienta valiosa para la prediccion de sitios de binding, como as tambien para la optimizacion de compuestos gua en el diseño de drogas.