Hidatidosis en la era genómica: Genoma de Echinococcus canadensis (genotipo G7).

MALDONADO L; ASSIS J; GOMES ARAUJO F; OLIVEIRA G; MACCHIAROLI N; CUCHER M; ROSENZVIT M; KAMENETZKY L

Congreso; Congreso Panamericano de Zoonosis. VIII Congreso Argentino de Zoonosis; 2014

Introduccion: Echinococcus canadensis es un parasito platelminto muy relacionado desde el punto de vista filogenético con Echinococcus granulosus y Echinococcus multilocularis, miembros de la clase cestode involucrados en infecciones hidatidicas en humanos y animales. En Suramérica se han reportado tres especies: E. granulosus s.s. (genotipos G1 y G2), E. canadensis (genotipos G6 y G7) y E. ortleppi. Hasta el momento se ha reportado limitada información genética de E. canadensis G7. El objetivo de este trabajo es secuenciar y analizar el genoma de esta especie. Materiales y métodos: Se extrajo ADN genómico de alta calidad de protoescolex de E. canadensis G7. Se construyeron bibliotecas ?paired-end? y la secuenciación se realizó con la tecnología Illumina. Se evaluaron varias metodologías usando diferentes parámetros hasta obtener el mejor ensamblado de novo mediante Velvet. Las lecturas fueron mapeadas sobre el genoma de E. multilocularis mediante BWA y se anotaron genes conservados utilizando CEGMA. Resultados: Estudios comparativos han revelado alto nivel de identidad nucleotídica, mayor al 95%, de E. canadensis G7, tanto con E. multilocularis como con E. granulosus s. s. G1. El procedimiento de anotación de genes in sílico realizado en este trabajo permitió identificar más de un 90% de los genes altamente conservados. Discusión: Este es el primer reporte del genoma de E. canadensis G7 obtenido mediante secuenciación paralela masiva que permite el abordaje del estudio genómico de esta especie. El conocimiento de la secuencia de este nuevo genoma permitirá realizar análisis de genómica comparativa y obtener información que podría utilizarse para la prevención diagnóstico de la hidatidosis. Bibliografia: Kamenetzky, L., A. M. Gutierrez, S. G. Canova, K. L. Haag, E. A. Guarnera, A. Parra, G. E. Garcia and M. C. Rosenzvit (2002). "Several strains of Echinococcus granulosus infect livestock and humans in Argentina." Infect Genet Evol 2: 129-136. Nakao M, Lavikainen A, Yanagida T, Ito A (2013) Phylogenetic systematics of the genus Echinococcus (Cestoda: Taeniidae). Int J Parasitol. 43:1017-29. Tsai IJ, Zarowiecki M, Holroyd N, Garciarrubio A, Sanchez-Flores A, Brooks KL, Tracey A, Bobes RJ, Fragoso G, Sciutto E, Aslett M, Beasley H, Bennett HM, Cai J, Camicia F, Clark R, Cucher M, De Silva N, Day TA, Deplazes P, Estrada K, Fernández C, Holland PW, Hou J, Hu S, Huckvale T, Hung SS, Kamenetzky L, Keane JA, Kiss F, Koziol U, Lambert O, Liu K, Luo X, Luo Y, Macchiaroli N, Nichol S, Paps J, Parkinson J, Pouchkina-Stantcheva N, Riddiford N, Rosenzvit M, Salinas G, Wasmuth JD, Zamanian M, Zheng Y; Taenia solium Genome Consortium, Cai X, Soberón X, Olson PD, Laclette JP, Brehm K, Berriman M (2013) The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism. Nature. 496:57-63. Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G, Zhu Y, Wang Y, Huang Y, Liu J, Kang H, Chen J, Wang L, Chen A, Yu S, Gao Z, Jin L, Gu W, Wang Z, Zhao L, Shi B, Wen H, Lin R, Jones MK, Brejova B, Vinar T, Zhao G, McManus DP, Chen Z, Zhou Y, Wang S. The genome of the hydatid tapeworm Echinococcus granulosus. Nat Genet. 2013;45:1168-75.