LABEL FREE QUANTITATION: TÉCNICA DE CUANTIFICACIÓN DE PROTEINAS CON UN

FERNANDEZ, JG; MORENO, S.; VALACCO, MP

Rosario, Santa Fe

Congreso; III Congreso Argentino de Espectrometria de Masas; 2016

SAEM

Label Free Quantitation: técnica de cuantificación deproteinas con un espectrómetro de masa Q Exactive Label Free Quantitation (LFQ), o Cuantificación Libre deMarcación, es una técnica ampliamente difundida dentro del campo de laproteómica que permite comparar las abundancias relativas de las proteínaspresentes en un mismo sistema biológico pero bajo los efectos de diferentesestimulaciones (temperaturas, mediosdecultivo, etc.). Esta técnica se puederealizar con diferentes tipos de equipamiento, siendo los más comunes losespectrómetros de masa Triple Quadrupolo o los equipos híbridos con tecnologíaOrbitrap, acoplados a cromatógrafos líquidos, UHPLC o nanoLC. El espectrómetrode masa Q Exactive, de la empresa Thermo Scientific, es uno de esto sequiposhíbridos. El mismo cuenta con un Quadrupolo, un analizador Orbitrap y una celdaHCD (High Collision Dissociation), que acoplado al nanoLC permite realizar LFQ.El presente trabajo consiste en comprobar la técnica mediante un sencilloexperimento y demostrar el potencial de la misma dentro de la proteómica. Elexperimento consiste en analizar con el Q Exactive tres muestras que contienenla misma concentración de un digerido tríptico de Saccharomyces cerevisiae ydiferentes concentraciones de un digerido tríptico de la proteína AlbúminaSérica Bovina (BSA). El objetivo será comprobar en primer lugar que se detectandiferencias de abundancias ignificativas en la BSA pero que estas diferenciasno se detectan en las proteínas de Saccharomyces cerevisiae, lo cual ya seríasuficiente para probar la técnica LFQ. Pero también se quiere ver que estasdiferencias detectadas se correlacionan con las diferentes concentraciones dela BSA