Interacciones no-covalentes nucleótido-fotosensibilizador usando métodos semiempíricos

C. A. FRANCA; R. PIS DIEZ; M. M. GONZÁLEZ; F. M. CABRERIZO; M. J. LAVECCHIA

Natal

Congreso; QUITEL-2012; 2012

Las interacciones no covalentes son de fundamental importancia para explorar estructurasmoleculares en sistemas biológicos. La descripción teórica de tales interacciones es compleja,principalmente porque éstas son mucho más débiles que las interacciones covalentes y,además, por el rol que juegan se deben tener en cuenta las energías de dispersión de London.Pavel Hobza y colaboradores introdujeron una extensión al método semiempírico PM6 con elobjeto de incluir estas interacciones (1).En este trabajo utilizamos este método con corrección por dispersión y puente de hidrógeno(PM6-DH+) para estudiar los complejos formados entre la molécula del fotosensibilizadornorharmano y el nucleótido 2'-deoxiadenosina-5'-monofosfato (dAMP) a diferentes valores depH. Esto es relevante ya que los fotosensibilizadores son compuestos capaces de absorberradiación UV y mediar entre ésta y el ADN para provocar daño celular.A través de una búsqueda conformacional usando algoritmos genéticos(2) obtuvimos 404, 325y 343 confórmeros de partida para los sistemas a pHs 2.5, 5.4 y 10.5, respectivamente, yoptimizamos sus geometrías al nivel de teoría PM6-DH+(3). Los calores de formacióncalculados están de acuerdo con las constantes de formación halladas experimentalmente(valores propios aún no publicados). Además, se observaron en las geometrías halladas lasinteracciones π-stacking propias de estos sistemas, y se caracterizaron las uniones de tipopuente de hidrógeno para los mismos