Estructura secundaria del tercer dominio del gen 16S ARNr de Biomphalaria peregrina (d´Orbignyi, 1835)

MAGIÁRATE, E.; KOCH, E.; VOGLER, R.E.; BELTRAMINO, A.A.; CIOCCO, N.F.

Piriápolis

Congreso; X Congreso Latinoamericano de Malacología; 2017

Asociación Latinoamericana de Malacología y Sociedad Malacológica del Uruguay en conjunto con el CURE de la Universidad de la República Oriental del Uruguay, el Museo Nacional de Historia Natural y la ONG InvBiota (invertebrados del Uruguay)

Los estudios filogenéticos apuntan a recobrar la señal histórica acumulada en la evolución de las secuencias de nucleótidos o aminoácidos. Los alineamientos de estas secuencias representan hipótesis que permiten inferir genealogías en un conjunto de especies. Así, un alineamiento adecuado es esencial para reconstruir relaciones evolutivas. Entre los marcadores mitocondriales comúnmente utilizados en moluscos para inferir tales relaciones se incluyen los genes ARNr. El alineamiento de secuencias de este tipo de genes resulta usualmente dificultoso por la presencia de eventos de inserción/deleción, los cuales incrementan en número con la inclusión de especies divergentes, evidenciado por múltiples posiciones ambiguas en el alineamiento final producido. Estas dificultades pueden subsanarse a través del uso de información complementaria como la estructura secundaria del ARNr. Basadas en la complementariedad de bases a lo largo de la molécula, las secuencias de ARN ribosomal forman estructuras complejas compuestas por tallos helicoidales conectados por bucles. Consecuentemente, a nivel estructural, en estas moléculas es factible reconocer secciones, subdivididas a su vez en dominios. En este trabajo se presenta un modelo estructural de los dominios cuarto y quinto del gen 16S ARNr de Biomphalaria peregrina (Gastropoda, Planorbidae). Las secuencias parciales del gen 16S ARNr fueron obtenidas utilizando cebadores universales a partir de un ejemplar de B. peregrina recolectado en la localidad de Uspallata (Mendoza, Argentina). El producto amplificado fue secuenciado en ambos sentidos en los laboratorios de la Unidad de Genómica del Instituto de Biotecnología (INTA, Castelar). Una vez obtenida la secuencia consenso, y previo alineamiento con secuencias de referencia disponibles en GenBank, la molécula fue plegada manualmente por comparación directa con modelos de referencia para moluscos. El modelo secundario aquí derivado representa el primero para las especies de Biomphalaria y se espera posibilite futuros abordajes comparativos de cambios estructurales en este género, así como complementar los análisis filogenéticos del grupo.