Caracterización de transcriptos no codificantes asociados a la expresión de la apomixis en Paspalum notatum.

OCHOGAVÍA, A. C; SEIJO, G.; GONZÁLEZ, A. M.; CERVIGNI, G.; PODIO, M.; PESSINO, S. C.

Rosario, Santa Fé - República Argentina

Congreso; VII Simposio Nacional de Biotecnología REDBIO Argentina y II Congreso Internacional-REDBIO-Argentina.; 2009

REDBIO Argentina

Caracterización de transcriptos no codificantes asociados a la expresión de la apomixis en Paspalum notatum Ochogavía, A. C1.; Seijo, G. 2; González, A. M. 2; Cervigni, G. 3; Podio, M. 1; Laspina, N.1; Duarte Silveira, E. 4; Machado Lacerda, A. L. 4; Carneiro, V.T.C. 4; Pessino, S. C. 1 La apomixis es una forma de reproducción clonal vía semillas. La caracterización de sus bases moleculares podría facilitar su uso controlado en la agricultura con enormes beneficios potenciales. En trabajos anteriores nuestro grupo identificó 65 transcriptos diferencialmente expresados en inflorescencias de plantas apomícticas y sexuales de Paspalum notatum. De ellos, 45 correspondieron a secuencias génicas mayoritariamente agrupadas en unas pocas clases ontológicas, pero 20 no fueron anotados funcionalmente por no mostrar homologías significativas en las bases de datos. El objetivo de este trabajo fue asignarles una identidad funcional probable a estos últimos transcriptos. Para 4 candidatos se diseñaron cebadores que amplificaron fragmentos del peso molecular esperado a partir del genoma y del transcriptoma. Las hibridizaciones in situ de tejidos reproductivos confirmaron su expresión diferencial. Se obtuvieron secuencias extendidas por 5´y 3´ RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends). Ninguno de los transcriptos mostró marcos de lectura abiertos (ORFs), aunque sí se observaron homologías completas con genes conocidos en sectores muy pequeños (25-400 nt). Búsquedas bioinformáticas más amplias indicaron que dos de las secuencias extendidas son homólogas a pre-miRNA. Se predijeron sus estructuras plegadas utilizando el programa Mfold. Las otras dos secuencias resultaron similares a retrotransposones de gramíneas que llevan segmentos de genes regulados diferencialmente durante el desarrollo apomíctico (serk, cyt P450). Un relevamiento del resto de las secuencias desconocidas demostró homologías con pre-miRNAs o retrotransposones portadores de segmentos génicos conservados cortos. Estos resultados sugieren un posible papel regulatorio para los transcriptos bajo estudio.