Aplicación de técnicas de Inteligencia Artificial ("Deep Learning") para clasificación y conteo de parásitos.

FIORENTINI, L.L.S.; TIMI, J.T.; ALARCOS, A.J.

Corrientes

Congreso; VIII Congreso Argentino de Parasitología; 2019

Universidad Nacional del Nordeste (UNNE), Facultad de Ciencias Exactas y Naturales y Agrimensura (FaCENA ? UNNE) Facultad de Odontología (FOUNNE ? UNNE), Consejo Nacional de Investigaciones Científcas y Técnicas (CONICET)

Grillotia carvajalregorum es una especie de cestode ampliamente distribuido entre los peces teleósteos del Atlántico Sudoccidental, que cumplen el rol de hospedadores intermediaros o paraténicos. Se enquistan en grandes números en sus tejidos, por lo que su conteo resulta dificultoso en numerosos casos. Con el objetivo de agilizar el registro de estos parásitos se implementó una aplicación con tecnología de ?deep learning? para el reconocimiento de quistes de dicha especie, presentes en el tejido parasitado del hospedador. Para la toma de imágenes digitales se utilizó como especie de hospedador-modelo a la anchoa de banco Pomatomus saltatrix. La metodología aplicada se trata de un modelo de redes neuronales artificiales que imita a las neuronas biológicas, conectadas entre sí y trabajando en conjunto, aprendiendo sobre el proceso (fase de entrenamiento de la red neuronal). Dados ciertos parámetros (hiperparámetros en la terminología de ?deep learning?) de la red neuronal, existe una forma de combinarlos para predecir un cierto resultado (etapa de inferencia), siendo el desafío descubrir los valores de dichos parámetros. En el presente estudio se realizó la clasificación de los quistes de G. carvajalregorum en imágenes de entrenamiento (ubicación, tipo de quiste, etc.). Luego, se entrenó una red neuronal de tipo ResNet con 10 épocas de entrenamiento y se obtuvo una eficacia de entrenamiento del 97%. Posteriormente, se validó el modelo entrenado con 5 imágenes nuevas (que no pertenecen al lote de entrenamiento) y se obtuvo una precisión de detección del 95,9%. Este estudio resulta novedoso en ictioparasitología ya que sólo existen algunos antecedentes en la aplicación de este tipo de tecnología en medicina. Se pretende avanzar en el desarrollo del proyecto para poder lograr un buen entrenamiento de la red neuronal, mejorar la eficiencia en el conteo y poder aplicarlo en el resto de las especies de peces marinos que albergan este parásito. Además, con el avance, será posible realizar una aplicación móvil de fácil y práctico uso en los muestreos de rutina de laboratorio. Este proyecto se logra gracias a la articulación entre investigadores de parasitología y Software del Centro, empresa especializada en inteligencia artificial.