Aislamiento y caracterización de secuencias repetidas en el género Arachis (Leguminosae).

CARISIMO DA; SAMOLUK, S; ROBLEDO, G; SEIJO, JG

Corrientes

Jornada; Jornadas de Ciencia y Técnica de la UNNE; 2008

UNNE

La diferenciación genómica en los eucariotas y principalmente en plantas ha sido determinada o acompañada por el cambio en el tipo y representación de secuencias repetidas. Las secuencias repetidas implicadas en este tipo de fenómenos, se encuentran las altamente repetidas con disposición en tandem o dispersas. Dentro de este último grupo de secuencias, las más representativas comprenden a los elementos móviles, transposones y retrotransposones.  La sección Arachis cuenta con 31 especies descriptas, 29 diploides silvestres (x=10 y x=9) y dos alotetraploides, entre ellas el cultígeno A. hypogaea (nv maní). Las entidades diploides fueron asignadas a tres genomas diferentes, A, B y D, siendo los tetraploides AABB. Por su parte, existen diversas especies diploides silvestres, tanto del genoma A como del genoma B, que presentan diversos caracteres de interés agronómico y que podrían incorporarse al maní cultivado por planes de introgresión.  Para el desarrollo racional de planes de mejoramiento es preciso generar información básica sobre la biología de las especies y sobre los sistemas genéticos de cada una. En este marco, los estudios que se vienen desarrollando en Arachis han demostrado que los mapas genéticos establecidos a partir de diferentes marcadores moleculares (RFLP, microsatélites, y RAPDs) son altamente co-lineales cuando se comparan especies del genoma A y del B, y que muchos de los marcadores son transferibles entre las especies. Sin embargo, los experimentos de hibridación genómica in situ (GISH) han demostrado que existe una gran diferenciación genómica entre estas especies, basada principalmente en secuencias repetidas. En este marco, uno de los planes de trabajo que se desarrollan en nuestro laboratorio esta orientado a la identificación, caracterización, y mapeo de los elementos repetidos que han conducido a la diferenciación genómica en el género y a la comprensión de los mecanismos cromosómicos y moleculares involucrados en ese proceso.  Considerando estos antecedentes, se ha comenzado a trabajar sobre la hipótesis de que la diferenciación genómica en Arachis está basada en los tipos y grado de representación de secuencias repetidas que poseen los genomas. El objetivo particular de este trabajo fue constatar la presencia de transposones en los genomas de maní cultivado. Se realizaron PCRs utilizando primers degenerados correspondientes a secuencias conservadas de la transposasa del elemento En/Spm-like. Los productos amplificados se purificaron, clonaron y caracterizaron por secuenciación. Los dos clones secuenciados no poseen homología nucleotídica, pero si revelaron homología a nivel aminoacídico. La comparación de la secuencia aminoacídica con las bases de datos públicas, demostró que ambas secuencias aminoacídicas corresponden a una familia de transposones En/Spm-like.  Estos resultados demuestran que parte de la fracción de las secuencias repetidas de Arachis estan conformadas por al menos dos elementos de la familia de transposones mencionada. Los experimentos de FISH en curso nos permitirán discernir si estos elementos presentan una distribución dispersa o en clusters, y si las mismas son genoma especifico.