INVESTIGADORES
URDAMPILLETA Juan Domingo
congresos y reuniones científicas
Título:
Identificacion de retroelementos tipo LTR in silico y su distribución cromosómica en Capsicum annuum (Solanaceae)
Autor/es:
YÁÑEZ A.; PAZ R.; ANDINO N.; URDAMPILLETA J.D.
Lugar:
Chacras de Coria, Mendoza
Reunión:
Congreso; XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica; 2017
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Botánica
Resumen:
El pimiento (Capsicum annuum) es una hortaliza perteneciente a la familia Solanaceae de gran valor económico y que cuenta con un gran número de cultivares comerciales y silvestres. Una gran porción del genoma de esta especie está constituida por retroelementos del orden LTR (del inglés, Long Terminal Repeats) con un potencial uso como marcadores moleculares para distinguir variedades. En trabajos bioinformáticos anteriores sobre el genoma de referencia de C. annuum cv. Zunla, hemos identifi cado 1235 retroelementos completos e intactos, de los cuales solamente 3 familias representan aproximadamente el 60% de los retroelementos detectados: GypsyZla_13 (6,2%), CopiaZla_01 (8,8%) y GypsyZla_16 (45,7%), perteneciente a los clados Del/Tekay, Retrofi t/Ale y Athila respectivamente. El análisis de secuencias permitió el diseño de cebadores específi cos sobre las regiones codifi cantes RT y RH. Los fragmentos amplifi cados por PCR, clonados y secuenciados, se utilizaron como sondas específi cas en métodos de hibridación in situ fl uorescente (FISH). Con el fi n de comparar la distribución y abundancia relativa de estas familias dentro del genoma C. annuum, las mismas fueron utilizadas para caracterizar diferentes cultivares de pimiento comerciales y silvestres. Nuestros resultados sugieren que existe una distribución diferencial de dichos retroelementos entre los cultivares evaluados. Financiamiento: D-TEC 0008/13 (AGENCIA, MINCyT, Argentina). PROJOVI 2015 (UNSJ).