INVESTIGADORES
BADANO Ines
congresos y reuniones científicas
Título:
ANÁLISIS DE BSK (BAYESIAN SKYLINE PLOTS) DEL FACTOR DE NECROSIS TUMORAL ALFA Y CITOCROMO B EN MONOS SUDAMERICANOS (PLATIRRINOS)
Autor/es:
FACHINI, AS; BREZISKI, MA; SANCHEZ-FERNANDEZ, C; BADANO, I
Lugar:
Mendoza
Reunión:
Congreso; XVII CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA; 2019
Institución organizadora:
Asociación Latinoamericana de Genética
Resumen:
Los estudios genéticos en monos sudamericanos (Platirrinos) contribuyen al conocimiento de su biología y evolución. El Factor de Necrosis Tumoral alfa (TNF) es un gen autosomal del sistema inmune y el citocromo B (CytB) es un gen mitocondrial ampliamente usado en taxonomía molecular. El objetivo de este trabajo fue realizar un análisis de BSK (Bayesian Skyline) de secuencias del promotor del TNF y CytB obtenidas en Platirrinos de la Argentina y Sudamérica, y aportar datos sobre la historia demográfica de estos primates. Los gráficos de BSK fueron estimados con el programa BEAST. Se analizaron 2 sets de datos: a) 20 secuencias del promotor del TNF obtenidas en Genbank y/o por nuestro grupo (N=16) y, b) 33 secuencias del CytB, obtenidas en Genbank. Los criterios de análisis fueron: reloj relajado (UNL) y una Tasa de mutación de 1x10-8 s/s/y. Se corrieron 10 millones de cadenas muestreadas de a 1000. La convergencia y la visualización del gráfico de BSK fue realizada en Tracer. La historia demográfica de ambos marcadores se inició hace 20.000.000 de años, fecha que coincide con aquella descripta para la divergencia de las familias de Platirrinos. El tamaño poblacional se mantuvo constante hasta iniciar un decrecimiento aprox. 1.5 MY de años atrás. El decrecimiento poblacional descripto por ambos marcadores podría reflejar la pérdida de diversidad provocada por las fluctuaciones climáticas durante el Pleistoceno en América. Futuros estudios con un mayor número de marcadores y secuencias permitirá ampliar estas hipótesis.