INVESTIGADORES
BADANO Ines
congresos y reuniones científicas
Título:
DIVERSIDAD GENÉTICA DEL VIRUS JC (JCV) Y SU APLICACIÓN AL ESTUDIO DEL POBLAMIENTO DE LA PROVINCIA DE MISIONES, ARGENTINA
Autor/es:
SANABRIA, DJ; MOJSIEJCZUK, L; MEYER, A; TORRES, C; MBAYED. V; LIOTTA, DJ; CAMPOS, RH; BADANO, I
Lugar:
CABA
Reunión:
Congreso; XII Congreso Argentino de Virología, V Simposio de Virología Clínica, III Simposio de Virología Veterinaria; 2017
Institución organizadora:
Asociación Argentina de Microbiologia
Resumen:
El análisis de la variabilidad genética de secuencias virales y su distribución geográfica aportan una nueva dimensión al estudio de las migraciones humanas y permiten comprender los orígenes y la dispersión de los linajes virales en la población. El poliomavirus John Cunningham (JCV, Familia Polyomaviridae, ADNdc 5Kb) es considerado una herramienta útil a tal fin; infecta a los humanos de manera persistente y asintomática (prevalencia del 70-90% a nivel mundial) y actualmente se han identificado siete tipos correspondientes a distintas regiones geográficas: África (Tipos 3,6), Asia (Tipo 2) y Europa (Tipos 1,4).El objetivo del trabajo fue describir la diversidad genética y el patrón de circulación viral de JCV en Misiones (Argentina) y contextualizar los resultados obtenidos en el marco histórico del poblamiento de la Provincia.Metodología: Se analizaron 68 muestras de orina de adultos sanos de la zona centro de Misiones. La extracción de ADN se realizó con el kit PuriPrep-S (InbioHighWay, Argentina). La detección de JCV se realizó por PCR anidada en la región VP1 (356 pb), y la tipificación viral por PCR y secuenciación directa de un fragmento mayor de la misma región (1200 pb de la VP1). Los cromatogramas se analizaron en CodonCodeAligner. Las secuencias se alinearon con ClustalX y los tipos virales se determinaron por filogenia (Máximum likelihood) con secuencias de referencia disponibles en GenBank (Tipos 1,2,3,4,6; n454). El análisis de circulación viral se realizó mediante gráficos de Redes de haplotipos o ¨Redes¨ (Network). Brevemente, cada secuencia viral única fue considerada como un haplotipo y los patrones de referencia en la interpretación del gráfico fueron: (i)Efecto fundador: un haplotipo en alta frecuencia y haplotipos derivados del mismo en baja frecuencia; y (ii)Mezcla genética: alto número de haplotipos en baja frecuencia.Resultados: La detección de JCV fue del 70,6% (48/68). La tipificación viral fue posible en el 44% (21/48) de las mismas. El análisis filogenético agrupó al 47% (10/21) de las secuencias con aquellas de origen Asiático-americano (Tipo 2), un 33% (7/21) con Europeas (Tipo 1) y un 19% (4/21) con Africanas (Tipo 3). El gráfico de Red mostró un alto número de haplotipos (13/21), cada uno en baja frecuencia, patrón característico de poblaciones mezcladas.Conclusiones: El alto porcentaje de detección de JCV coincide con lo descripto en otras poblaciones a nivel mundial (70-90%). Los tipos detectados (amerindio, europeo y africano) podrían estar vinculados a los procesos de poblamiento de Misiones, incluyendo Nativos Americanos (Guaraníes), Inmigrantes europeos y migrantes fronterizos de Brasil. Es interesante que ninguno de los linajes virales presentó un efecto fundador en la población, sino que todos coexisten en bajas frecuencias en la población. Estos datos aportan una nueva herramienta al estudio de la epidemiología de JCV y el poblamiento de Misiones. Financiamiento: Parcialmente financiado PICT 2012/761.