Análisis de la estructura y función de comunidades procariotas oxidantes del amoníaco en la rizosfera de un cultivo de cobertura bajo diferentes métodos de supresión

ALLEGRINI, M.; MORALES, M.E.; IOCOLI, G.A.; BASUALDO, J.; VILLAMIL, M.B.; ZABALOY, M.C.

La Plata

Congreso; V Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental (V CAMAyA); 2021

Asociación Argentina de Microbiología

Las comunidades oxidantes del amoníaco desempeñan un rol clave en el ciclo del nitrógeno a través del proceso de nitrificación. Si bien el comportamiento de las comunidades nitrificantes a la fertilización ha sido extensamente estudiado, la estructura y función de las comunidades nitrificantes frente a la supresión de cultivos de cobertura invernales (CCI) se desconocen. Los procesos de rizodeposición y de degradación de residuos vegetales en plantas suprimidas mecánica o químicamente podrían influenciar diferencialmente a las comunidades oxidantes del amoniaco y las transformaciones del N asociadas a estos grupos. El objetivo de este estudio fue analizar si el método de supresión del CCI (Avena sativa L.) influye diferencialmente sobre la estructura de las comunidades procariotas oxidantes del amoníaco de la rizosfera. Se realizó un ensayo a campo en bloques completos aleatorizados (n = 4) durante los años 2018 y 2019 en un campo experimental perteneciente a la Universidad Nacional del Sur (Colonia Napostá). La supresión del crecimiento del CCI (estadio Z5.5) se realizó mediante acción mecánica (R, rolo faca de tiro manual) o química (DQ, glifosato, 3 L ha-1). Se obtuvo suelo rizosférico antes de la supresión del CCI (sin supresión, SS) en tanto la rizosfera de los tratamientos DQ y R se muestreó cuando las plantas mostraron signos claros de desecación. Se extrajo el ADN metagenómico mediante el kit DNeasy PowerSoil (Qiagen, GmbH, Alemania) para su posterior análisis mediante secuenciación masiva de amplicones del gen amoA con la plataforma MiSeq (Illumina) y análisis de secuencias con QIIME2. Los datos se ingresaron luego en la plataforma de detección de predictores JMP® (SAS Institute Inc.) y las unidades operativas taxonómicas (OTUs) con una contribución mayor al 10% se analizaron estadísticamente por modelos lineales mixtos en el software estadístico SAS, previa aplicación de la transformación de Aitchison (centered-log ratio). Se realizó también un análisis multivariado de las comunidades mediante componentes principales. El análisis funcional se llevó a cabo mediante medidas de nitrificación potencial (NP). En los dos años de estudio no se observó una separación de las comunidades en respuesta a los diferentes tratamientos (R, DQ y SS). Asimismo, tanto las OTUs como la NP no mostraron un efecto significativo del tratamiento (P > 0.05). El análisis filogenético de BOA indicó el agrupamiento de seis OTUs junto a secuencias del cluster 3 de Nitrosospira mientras que dos de las OTUs se ubicaron más próximas a representantes de los cluster 0 y 2. Los resultados demuestran que el método de supresión del CCI no ejerce un efecto significativo en la actividad nitrificante y en la estructura de dos grupos microbianos de reconocida sensibilidad como indicadores, en dos años de manejo del suelo con CCI. No obstante, se requieren estudios de mayor duración, con diferentes CCI y en distintos suelos para obtener evidencias concluyentes al respecto.