Genética y genómica aplicada al estudio de la hidatidosis

MALDONADO, LUCAS; MACCHIAROLI, NATALIA; CUCHER, MARCELA; CAMICIA, FEDERICO; ROSENZVIT, MARA; GUILHERME OLIVEIRA; KAMENETZKY, LAURA

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental I Jornada de Microbiología General; 2018

Los parásitos helmintos causan enfermedades de gran importancia socioeconómica en todo el mundo, ya que tienen un impacto importante en la salud humana y constituyen una enorme carga a su desarrollo, en la producción animal y agricultura. Son los agentes infecciosos más frecuentes en humanos en países en vías de desarrollo y colectivamente el daño a la salud humana es comparable con las principales enfermedades de alta mortalidad, como el VIH/SIDA o la malaria. El parásito Echinococcus canadensis G7 (filo Platelmintos, clase Cestoda) es uno de los agentes causantes de la echinococcosis, zoonosis crónica que afecta tanto a los seres humanos como a mamíferos domésticos y silvestres, y es considerada una enfermedad prioritaria por la Organización Mundial de la Salud.Dada su gravedad e incidencia en el mundo, nuestro grupo de investigación secuenció, ensambló y anotó el genoma de 115 Mb de E. canadensis G7. Se identificaron 11435 genes y mediante análisis de ortología se determinaron 881 grupos de genes específicos de cestodos y 581 grupos específicos del género Echinococcus que permitieron identificar genes que podrían ser nuevos blancos terapéuticos.Asimismo, análisis de genómica comparativa realizado entre tres especies de Echinococcus reveló un alto grado de variabilidad genética entre E. canadensis G7 y E. granulosus G1, que fueron confirmados por análisis filogenéticos basados en SNPs, a pesar de que ambas especies pertenecen al complejo E. granulosus sensu lato y presentan un fenotipo similar del estadío de metacestodo. Asimismo, se identificaron SNPs en genes del metabolismo y su validación permitió desarrollar nuevos marcadores moleculares nucleares para diferenciar las especies de Echinococcus que infectan a animales y al hombre en Argentina. Además se estudiaron cuatro características biológicas particulares; la distribución de islas CpG, el sistema de metilación del ADN, componentes de la vía de pequeños ARN basados en el análisis estructural proteína-ARN y el uso de codones de Echinococcus que sugieren el hallazgo de mecanismos de regulación génica aún desconocidos y diferenciales entre las especies. Los datos generados aquí contribuyeron a la construcción de la base de datos WormBase ParaSite especializada en parásitos helmintos y del Nodo Bioinformático IMPaM en el que se implementaron herramientas especializadas para el análisis de cestodos que puede ser utilizada para el diseño de nuevas herramientas de control.