APLICACIÓN DE TECNOLOGÍAS ÓMICAS PARA LA BÚSQUEDA DE GENES ASOCIADOS AL BIOCONTROL DE PATÓGENOS EN UNA CEPA DE BACILLUS ALTITUDINIS AISLADA DE ILEX PARAGUARIENSIS ST. HIL.

CORTESE J.; BICH G. A.; CASTRILLO M. L.; ZAPATA P. D.; LACZESKI M. E.

BUENOS AIRES

Congreso; XV Congreso Argentino de Microbiología (CAM) ? 2019; 2019

ASOCIACION ARGENTINA DE MICROBIOLOGIA

Las rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) son un grupo de bacterias que colonizan las raíces y otros tejidos de las plantas, proporcionando efectos benéficos sobre el crecimiento y desarrollo de las mismas. El efecto directo de las PGPR es favorecer la biodisponibilidad de nutrientes para las plantas. Además, algunas cepas como las del género Bacillus son capaces de producir compuestos microbianos y metabolitos secundarios vinculados al control de patógenos, lo cual potenciaría su uso como bioinsumo. El conocimiento de los genes vinculados al control biológico en bacterias es aún escaso. Las tecnologías ómicas dirigidas a la detección universal de genes (genómica), presentan herramientas informáticas útiles para la detección y el estudio de genes asociados a las propiedades de biocontrol. De acuerdo a lo expuesto, el presente trabajo tuvo como objetivo buscar y reportar genes asociados al control biológico en una cepa de B. altitudinis aislada de yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.) en Misiones, seleccionada por sus propiedades como PGPR. Para ello se recuperó la cepa bacteriana B. altitudinis 19R conservada en el cepario del Instituto de Biotecnología de Misiones perteneciente a la Universidad Nacional de Misiones. A partir de un cultivo de 24 h en caldo nutritivo se extrajo ADN genómico. El ADN de alta calidad fue enviado a Macrogen-Corea para la generación de una biblioteca Rapid shotgun para gADN y la generación de una secuenciación whole genome de novo mediante la tecnología Illumina Inc. Para la detección de genes de biocontrol se utilizaron como referencia las secuencias obtenidas del genoma anotado de B. altitudinis cepa SGAir0031 (CP022319). La búsqueda y análisis de los genes se realizó con el software Geneious (11.0.1). Las secuencias obtenidas se compararon con la bases de datos de secuencias de nucleótidos y proteínas del National Center for Biotechnology Information (NCBI), utilizando las plataformas BLASTn y BLASTx respectivamente. A partir de este procedimiento se obtuvieron las secuencias nucleotídicas para los siguientes genes con los respectivos números de acceso: bacA(MK934835), tua (MK934838), bioB (MK934834), acnA (MK934833), bsaA (MK934836), yngG (MK934839), yoxA (MK934840) y nirK (MK934837). Al contrastar la información obtenida con la existente en las bases de datos se obtuvieron valores mayores al 98% de identidad con regiones genómicas de cepas reportadas de B. altitudinis. A partir de los resultados obtenidos en el presente trabajo remarcamos la importancia del estudio genómico de microorganismos con capacidades PGPR para su implementación como alternativa sustentable al mejoramiento del rendimiento y biocontrol de patógenos de los cultivos.