Análisis del polimorfismo y la divergencia nucleotídica de Lsd-2, un gen candidato para el tamaño corporal

CARREIRA V.P.; CORIO C.; RUSSO M.G.; FANARA J.J.; HASSON E.

Belém

Congreso; VII Simpósio de Ecologia, Genética e Evolução de Drosophila; 2011

Eltamaño del cuerpo es un carácter adaptativo cuya variación tienebase genética, depende de factores ambientales y muestra múltiplesinteracciones con otros componentes del fitness. En trabajosprevios, hemos estudiado la variación de diferentes caracteresvinculados al tamaño corporal en líneas derivadas de poblacionesnaturales de D. melanogaster dispuestas a lo largo degradientes geográficos de Argentina y hemos identificado genescandidatos a participar en su expresión. En este contexto nospropusimos realizar un análisis genético-poblacional de lavariación nucleotídica de los genes que mostraron un efecto mayorcon respecto a los caracteres estudiados. Uno de ellos es Lipidstorage droplet-2 (Lsd-2), el cual está vinculado a laregulación del transporte y almacenamiento de lípidos. En estetrabajo, analizamos la secuencia completa del gen en 29 líneasisogénicas norteamericanas para las que contamos con la secuencia detodo el genoma. Asimismo, estudiamos dos fragmentos del gen en laslíneas referidas así como en isolíneas derivadas de las cuatro poblaciones argentinas que constituyen los extremos de los gradientesgeográficos (latitudinal y altitudinal) estudiados anteriormente. Elanálisis de la secuencia completa (4748 pb) reveló la existencia de31 sitios polimórficos (19 con una variante presente sólo en unasecuencia ?singletons- y 12 con dos variantes presentes, cada una,en más de dos secuencias ?sitios informativos-). Tres de estossitios segregantes se encuentran en la región codificante del gen yestán asociados a sustituciones sinónimas. El análisis delfragmento del gen que incluye al exón 5 (538 pb, n = 47), reveló laexistencia de 10 sitios polimórficos (7 singletons y 3 informativos)de los cuales sólo uno está asociado a una sustitución sinónima.Por otro lado, el análisis del fragmento del gen que incluye al exón4 (702 kb, n = 46), mostró la existencia de 6 sitios polimórficos(2 singletons y 4 informativos) de los cuales dos están asociados asustituciones sinónimas. Para este fragmento se observó unainserción de 12 pb en la región no codificante en dos líneasderivadas de dos poblaciones diferentes (una de cada extremo delgradiente latitudinal). Para ambos fragmentos el número medio desustituciones nucleotídicas por sitio entre poblaciones fue muybajo. Finalmente, los distintos análisis mostraron valoressignificativamente diferentes de los esperados según un modelo deevolución neutra considerando distintos estadísticosgenético-poblacionales (Dt, D*, F*, Fs, R2, etc.).Globalmente, los resultados muestran que Lsd-2 presenta escasavariación nucleotídica así como poca diferenciación entrepoblaciones lo que sugiere que su función relacionada con elmetabolismo lipídico se encuentra conservada. Asimismo, los valoresobtenidos para distintos estadísticos sugieren que las poblacionesde D. melanogaster han sufrido una expansión poblacional.Todos estos resultados son discutidos tomando en consideración lasecuencia presente en otras especies de Drosophila.