Oblitimonas alkaliphila con 4 Integrones de clase 2 en el ambiente clínico

MASSÓ MG; CENTRON D; QUIROGA MP

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental - I Jornada de Microbiología General; 2018

Asociación Argentina de Microbiología

Oblitimonas alkaliphila gen.nov., sp.nov., es una especie recientementeidentificada durante un estudio retrospectivo de aislamientos clínicos de 1970.El genoma de la cepa E5571 de O.alkaliphila fue secuenciado por MySeq y depositado en el GenBank por el Centers for Disease Control and Prevention(CDC, Atlanta, Estados Unidos), sin hacer mención a la presencia de integrones asociadosa multirresistencia antibiótica. El objetivo del presente trabajo fueinvestigar por métodos de Bioinformática la presencia de mecanismos asociados aresistencia antibiótica.Seanalizó el genoma de O. alkaliphiladepositado en GenBank. Mediante Blast se identificó número, clase yfuncionalidad de los integrones y los genes cassette(GC). Enel genoma de O. alkaliphila E5571 seidentificaron 4 integrones de clase 2 (IC2), cromosómicos. Dos integronesposeen un alelo de intI2 no funcionaly están embebidos en tn7; en cambio los otros dos integrones contienen intI2 funcional y no están asociados almódulo tnsABCDE de tn7. Ninguno delos integrones se encuentran ubicados en el sitio attTn7/glmS. Las zonas variables presentanarreglos con genes cassette queconfieren resistencia a múltiples antibióticos. No se halló otra clase deintegrones.Sibien la mayoría de los IC2 modernos fueron sujetos a evolución convergente y seembebieron en Tn7, facilitándoles su diseminación y perpetuación, en estegenoma que data de más de 40 años atrás, se distinguen caracteres primitivostales como la no asociación al sitio attTn7, la presencia de alelos intI2 funcionales, y la falta de inmunidada la invasión de otros tn7, encombinación con caracteres modernos como la presencia de IC2 con intI2 truncada y asociados al módulo tnsABCDE. Esto evidencia que durante elproceso de adaptación hubo acumulación de eventos de recombinación y delecionesen los que estuvo involucrado Tn7 quepueden a futuro, dar origen a rearreglos de mayor complejidad como la formaciónde islas genómicas.