Escherichia coli uropatógena con arreglos novedosos de integrones de clase 1 y 2

MASSÓ MG; ALVAREZ VA; MARQUEZ C; LABBATE M; STOKES HW; QUIROGA MP; CENTRON D

Mar del Plata

Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental - I Jornada de Microbiología General; 2018

Asociación Argentina de Microbiología

LosIntegrones de clase 1 (IC1) y 2 (IC2) son plataformas genéticas asociadas aresistencia antibiótica en las cepas clínicas. Poseen el gen de la integrasa (intI) que cataliza la recombinaciónsitio específica, un sitio de recombinación (attI) y un promotor (Pc)para la expresión de los genes cassettes(GC) que a su vez contienen sitios de recombinación propios (attC). En 2008 se recuperó unaislamiento de Escherichia coli delambiente clínico, uropatógena, que contiene tanto IC1 como IC2. El objetivo delpresente trabajo fue estudiar los integrones presentes en E. coli 8157 y sus mecanismos de diseminación.E. coli 8157 se subcultivó durante 30 días enmedio líquido LB con agitación a 37°C. Se sembraron alícuotas cada 15 días y semonitoreó la presencia o ausencia de intI1e intI2 por PCR (N=30 colonias). Sesecuenció el genoma de E. coli 8157(Illumina MiSeq®) y se ensambló con SPAdes y plasmidSPAdes. Se utilizaron losprogramas PlasmidFinder, IntegronFinder y ResFinder. Se realizaronalineamientos contra la base de datos de GenBank para identificar determinantesde patogenicidad y de resistencia antibiótica.Tanto intI1 como intI2 se mantuvieron en el 100% de las UFC al cabo de 30 días.  IC1 e IC2 están contenidos en un mismoplásmido conjugativo de aproximadamente 160 kb que presenta regiones conidentidad con representantes de las familias de plásmidos conjugativos incFII eincFI. El IC1 presenta un arreglo novedoso de 7 GC, y está embebido en Tn21. El IC2, si bien tiene una intI2 funcional, presenta una deleciónde los genes de transposición de Tn7y lleva 3 GC, dos de ellos de función desconocida. Se detectaron, además, almenos otros 2 plásmidos pertenecientes a los grupos de incompatibilidad Col156.Laasociación del IC2 a un Tn7 defectivoda cuenta de que la dispersión de este integrón en particular se encuentradictada principalmente por el rango de huésped de plásmido que lo contiene. Elmantenimiento de ambos integrones en ausencia de presión antibiótica, evidenciala estabilidad de los mismos en este entorno genético. La combinación de IC1 eIC2 funcionales que presenta E. coli 8157es inusual en la clínica y manifiesta una historia única de eventos adaptativossujetos a Transferencia Horizontal Genética. En conjunto estos resultados acentúanla importancia de los integrones como plataformas de captura combinada yexpresión de GC por ambos integrones.