Diseminación global de In127 e In167 por herencia vertical de S. Typhimurium DT104 portadoras de la Isla Genómica SGI1

ÁLVAREZ VE; CAMPOS J; VILACOBA E; GIACOBONE G; QUIROGA MP; RAMÍREZ MS; CENTRÓN D.

Rosario

Congreso; XIV Congreso Argentino de Microbiología, XXIII Congreso Latinoamericano de Microbiología (CAM/ALAM 2016); 2016

Asociación Argentina de Microbiología/Asociación Latinoamericana de Microbiología

Los integrones declase 1 son los elementos genéticos más exitosos en la adquisición, expresión ydiseminación de genes de resistencia a antibióticos en aislamientos clínicosmultirresistentes. En Salmonella entericapueden  localizarse tanto en plásmidos comoen la isla genómica 1 (SGI1). SGI1 posee una región de resistencia múltiple aantibióticos llamada In104, la cual contiene a los integrones In127 (aadA2) y a In167 (blaPSE-1). Nospreguntamos los pasos que tuvieron lugar en la diseminación global de estosintegrones. Para ello, primero se analizó la presencia de los genes intI1 e int de SGI1 mediante cartografía por PCR y secuenciación en 84cepas clínicas no relacionadas epidemiológicamente (1971-2014)  y en 33 cepas aisladas de animales de granja(2006-2010) de 8 serovariedades de Salmonellaenterica. Se determinó que sólo 3 cepas de Salmonella Typhimurium DT104 clínicas poseían SGI1-A (2005-2006).  Posteriormente, utilizando Blastn e INTEGRALL,se identificó  a aadA2 en 514 entradas de GenBank y 292 de INTEGRALL incluyendo lasislas tipo SGI1 de Salmonella entericay de Proteus mirabilis (n=8). In127fue hallado en 82 de las 292 zonas variables de los integrones de clase 1 deINTEGRALL. Por otro lado, blaPSE-1 fue identificado en 93 entradasen GenBank y 32 de INTEGRALL. In167 fue encontrado en 15 entradas de las 32regiones variables identificadas en INTEGRALL, mayoritariamente de Salmonella enterica. El gen intI1 de In167 está deletado y unido a DgroEL en la SGI de Salmonellaspp. aunque los 301 nt de DintI1 son idénticos a los de In127. A través del análisisdel genoma completo de los tres aislamientos de S. Typhimurium DT104 con el de otros 10 genomas de los cincocontinentes aislados desde el año 1995 al 2010, se mapearon con una referenciade DT104 utilizando Smalt y Samtools. Se identificaron los SNPs y se realizó elanálisis filogenético con RAxML. De este análisis filogenético se puede ver queestos aislamientos tienen el mismo  ancestrocomún, revelando  la diseminación clonal  de la isla genómica SGI1. Estos resultados ensu conjunto indicarían que hubo un evento exitoso de adquisición de SGI1 en elgen trmE en una cepa de S. Typhimurium DT104 posiblemente antesde la era antibiótica. Posteriormente,  SGI1 adquirió a In127 e In167 en In104,plataforma que se seleccionó bajo presión antibiótica. Luego, mediante eventosde herencia vertical más que por los mecanismos de la Transferencia HorizontalGenética, este linaje se diseminó y se seleccionó en la clínica a nivel global.Esporádicamente, hubo invasiones de SGI1 a otras serovariedades y/o especies. Esteescenario pone en evidencia el rol activo que cumple la herencia vertical asícomo la captación de integrones de clase 1 por parte de islas genómicas para ladiseminación global de los integrones asociados a multirresistencia antibiótica.