Estudio de la variabilidad del gen intI1 y el sitio attI1 presentes en aislamientos clínicos y la dispersión de este último en los genomas bacterianos

QUIROGA MARÍA PAULA; NARDELLI MAXIMILIANO; RAMÍREZ MARÍA SOLEDAD; CENTRÓN DANIELA

Ciudad Autónoma de Buenos Aires

Congreso; XII Congreso Argentino de Microbiología, VI Congreso Argentino de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínica, SADEBAC, I Congreso de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2010

Asociación Argentina de Microbiología

Los integrones de clase 1 son elementos genéticos que contienen los componentes de un sistema de recombinación sitio específico y generalmente están asociados a multirresistencia antibiótica en aislamientos clínicos. Están compuestos por el gen intI1, que codifica la recombinasa IntI1, el sitio de recombinación attI1, y la región promotora Pc que permite la expresión de los genes cassettes. Los genes cassettes consisten de un marco de lectura abierto y un sitio de recombinación attC, que es reconocido por la integrasa para escindir del integrón el gen cassette e insertarlo en el attI1 o en otro attC. En nuestro laboratorio, encontramos ordenamientos atípicos dentro de la región variable de integrones de clase 1 y 2, donde los sitios attC esperados fueron reemplazados por una deleción de los sitios de recombinación attI1 o attI2, generando genes cassettes inusuales. El objetivo de este trabajo fue evaluar la variabilidad del gen intI1 y del sitio attI1 de aislamientos clínicos e investigar la dispersión del attI1 en los genomas bacterianos. Utilizamos el algoritmo Blastn del programa de herramientas de búsqueda de alineamiento básico local (BLAST) del sitio web PubMed [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/]. Cuando fue necesario, se utilizó la base de datos de microbios BLAST, optimizando la búsqueda incluyendo sólo los genomas completos y ajustando los parámetros del algoritmo. Encontramos que dentro de las 212 muestras clínicas que presentaban el gen intI1 completo y el sitio attI1 en la base de datos GenBank, hay 16 alelos del gen intI1, con mutaciones puntuales. El sitio attI1 también mostró mutaciones puntuales pero en pocos casos y no siempre asociadas con el mismo intI1. De la búsqueda del sitio attI1 en los genomas, encontramos que en su versión completa siempre se encontró asociado al gen intI1. También encontramos deleciones, comprendiendo la porción de 13 pares de bases de este sitio que fue encontrada previamente asociada a algunos genes cassettes inusuales y en este estudio fueron identificadas en 115 de 696 genomas analizados. Conclusiones Mientras que hay una variedad de alelos de intI1 entre las muestras clínicas, el attI1 muestra una estabilidad remarcable mostrando que esta asociación fue seleccionada y está bien establecida. La dispersión de las deleciones del attI1 (comprendiendo la porción que se encontró asociada a algunos genes cassettes inusuales) en los genomas bacterianos pertenecientes a grupos bacterianos distantes, mostró que la integrasa IntI1 tiene numerosas oportunidades de recombinar en la naturaleza.