INVESTIGADORES
QUIROGA Maria Paula
congresos y reuniones científicas
Título:
Elevada frecuencia de movilización del intrón de grupo II bacteriano S.ma.I2 de Serratia marcescens
Autor/es:
QUIROGA MARÍA PAULA; NARDELLI MAXIMILIANO; QUIROGA CECILIA; CENTRÓN DANIELA
Lugar:
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XII Congreso Argentino de Microbiología, VI Congreso Argentino de la Sociedad Argentina de Bacteriología, Micología y Parasitología Clínica, SADEBAC, I Congreso de Microbiología Agrícola y Ambiental; 2010
Institución organizadora:
Asociación Argentina de Microbiología
Resumen:
Los intrones del grupo II son ribozimas capaces de auto-escindirse mediante el mecanismo de splicing y movilizarse a nuevas regiones de un genoma. Los intrones del grupo II codifican en su secuencia una proteína que actúa como cofactor. Esta proteína, conocida como IEP, posee tres actividades: maturasa, transcriptasa reversa y endonucleasa. La IEP se asocia al ARN del intrón formando el complejo ribonucleoproteico (RNP), el cual reconoce nuevas regiones de un genoma mediante el apareamiento de los sitios EBS en el intrón con los sitios IBS en el ADN. Una vez apareados las RNPs con el ADN, el intrón del grupo II se introduce en el ADN blanco utilizando un mecanismo ARN dependiente. El intrón del grupo II de la clase C-attC S.ma.I2 fue encontrado en un integrón de clase 1 del aislamiento clínico Serratia marcescens SCH909. S.ma.I2 interrumpe el sitio de recombinación, o attC, del cassette de resistencia a antibióticos aadB localizado en la región variable del integrón. Estudios previos realizados en nuestro laboratorio demostraron que S.ma.I2 invade diferentes attCs mediante un mecanismo de recombinación sitio específica ARN dependiente. Este mecanismo no solo requiere de los sitios de unión EBS y los sitios de unión IBS si no que también necesita de la estructura secundaria provista por el attC. Por otro lado, estudios evolutivos sugieren que el intrón S.ma.I2 comparte un ancestro con intrones de la clase C-attC localizados en el genero Shewanella, el cual reconoce estructuras secundarias similares a los attCs. El objetivo de este trabajo es comparar la capacidad de movilización del intrón S.ma.I2 a sitios blanco provenientes de diferentes entornos genéticos mediante ensayos de movilidad realizados in vivo. Se seleccionaron como sitio blanco a diferentes attC y estructuras secundarias y se realizaron ensayos de movilidad in vivo para el intrón S.ma.I2 mediante PCR de colonia. Los  productos obtenidos fueron secuenciados. Se observó que el intrón S.ma.I2 invade los sitios blanco propuestos pero a muy diferentes frecuencias. Para el attCsat2 se obtuvo una frecuencia de invasión del 1% mientras que para el sitio shSAR-1, encontrado en el genoma de Shewanella spp., se alcanzó una frecuencia del 15%. Nuestros resultados demuestran que el intrón S.ma.I2 no sólo reconoce diferentes sitios attC sino que también es capaz de invadir sitios en los que se habían encontrado insertos otros intrones del GII de clase C-attC y los reconoce con frecuencias muy dispares. Asimismo, la elevada frecuencia de invasión al sitio shSAR-1 aporta nuevas evidencias que sugieren que el intrón S.ma.I2 está ligado desde el punto de vista evolutivo a los intrones del género Shewanellaceae.