Uso de retroelementos LTR como marcadores moleculares cultivar-específicos en Capsicum annuum

YÁÑEZ A.; URDAMPILLETA J.D.; ANDINO N.; FARRÁN L.; PAZ R.

San Juan

Congreso; II Reunión Argentina de Jóvenes Botánicos; 2016

Sociedad Argentina de Botánica

El pimiento (Capsicum annuum) es una hortaliza perteneciente a la familia de las Solanáceas de gran valor económico a nivel mundial. Esta especie se caracteriza por tener un genoma significativamente más grande (~ 3.20 Gb), comparado con otras especies de la misma familia, no obstante esta acumulación de ADN se debe mayoritariamente a la amplificación de secuencias de ADN repetitivo (elementos móviles y ADN satélite). En trabajos bioinformáticos anteriores, analizando el genoma de referencia de C. annuum cv. Zunla, hemos identificado 1235 retroelementos del tipo LTR completos e intactos distribuidos en 207 familias, donde solamente 3 familias representan aproximadamente el 60% de los retroelementos identificados: GypsyZla_13= 77 (6, 2 %); GypsyZla_16 = 654 (45,7%) y CopiaZla_01= 109 (8,8 %), perteneciente a los clados Del, Athila y Retrofit respectivamente. Con el fin de comparar la distribución y abundancia relativa de estas familia dentro de la especie C. annuum, diseñamos sondas de hibridación in situ fluorescente (FISH) específicas sobre la región codificante de dichos retroelementos con longitud de fragmentos amplificados entre ~950 a 1070 pb y las utilizamos para marcar cariotipos de diferentes cultivares y ecocultivares de pimiento. Los mismos fueron amablemente proporcionados por la empresa semillera FECOAGRO San Juan LTDA (San Juan, Argentina), el Dr. Cheng Qin (China) e INTA La Consulta (Mendoza, Argentina). El análisis de los resultados reveló diferencias en cuanto a la abundancia y distribución de estos retroelementos entre los diferentes cultivares empleados, indicando su potencial uso como marcadores moleculares cultivar-específicos.