INVESTIGADORES
FERRERAS Julian Alberto
congresos y reuniones científicas
Título:
MICROHETEROGENEIDAD DEL GEN 16S RRNA DE UNA CEPA DE Streptomyces sp. AISLADA DE MUESTRAS DE SUELO DE LA PROVINCIA DE MISIONES
Autor/es:
KLEINBIELEN TAMARA; CENTENO CELIA; URQUIZA J; VALLE LISBOA SILVINA; WOLIN INGRID; GALEANO DARIO; MARTINA P; FERRERAS JA
Lugar:
Catamarca
Reunión:
Congreso; XLVI CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA. IV JORNADA REGIONAL NOA; 2017
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genética
Resumen:
Se sabe que distintas especies bacterianas pueden tener más de una copia del operón que codifica para el gen 16S rRNA y que un porcentaje de ellas pueden presentar micro-heterogeneidad (2 % ) entre las copias. Como este fenómeno puede afectar la interpretación de los resultados de los diferentes estudios de diversidad microbiana, es de suma importancia conocer que tan general es la presencia o no de copias heterogéneas de este gen en un mismo organismo. En este trabajo reportamos la presencia de al menos dos variantes del gen 16S rRNA de una cepa de Streptomyces sp. aislada de muestras de suelo de la provincia de Misiones. El gen 16S rRNA se amplificó casi en su totalidad a partir de los oligos universales 27F y 1492R y la secuencia se obtuvo a partir del ensamblaje de las secuencias obtenidas a partir de los oligos antes mencionados y los oligos internos universales 518F y 800R. Usando la herramienta BLAST se determinó una identidad del 99 % principalmente con S. chartreusis, pero también otras especies como S. resistomycificus, S. osmaniensis, y otras cepas no determinadas. En el análisis del electroferograma se pudo observar la presencia de más de un pico de altura similar entre las posiciones 953 y 968 de la secuencia parcial obtenida. Al estar presente esta superposición en las diferentes secuencias con diferentes oligos, se descartó que se deba a un error de lectura y se consideró la presencia de al menos dos variantes del gen. Esta región de micro-heterogeneidad se encuentra entre la región V5 y V6 y quedó determinada como SSWYYAGAGATRGYSS.
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