INVESTIGADORES
KAMENETZKY Laura
congresos y reuniones científicas
Título:
Aplicaciones biotecnológicas de perfiles metabólicos en plantas cultivadas.
Autor/es:
KAMENETZKY L.; ASIS R.; URIAS U.; CONTE M.; DOMINGUEZ G.; HOPP E.; ROSSI M.; FERNIE A. R.; CARRARI F.
Lugar:
Buenos Aires
Reunión:
Congreso; XXXVI Congreso Argentino de Genética; 2007
Resumen:
La aplicación de herramientas
de alta procesividad y resolución al estudio de sistemas biológicos complejos
permite el monitoreo de las variaciones en los contenidos de las moléculas que
caracterizan la calidad de los cultivos. El análisis por cromatografía gaseosa
acoplada a espectroscopía de masa ha sido utilizado como herramienta en la
detección, cuantificación y sistematización de metabolitos primarios (mayoritariamente
azúcares solubles, ácidos orgánicos y aminoácidos) en frutos de 76 líneas
introgresadas de tomate (Solanum lycopersicum x Solanum pennellii). Dicho análisis ha permitido asociar
regiones genómicas a lo largo de todo el genoma de tomate a las variaciones
observadas en los frutos (QMLs). El mapeo físico de la regiones de interés,
conjuntamente con la identificación de variantes alélicas de genes candidatos
permitirá la disección de los principales determinantes genéticos de la calidad
de los frutos de tomate. Se seleccionaron marcadores moleculares posicionados
en 5 regiones diferentes (BINs) y se utilizaron en el análisis de dos
bibliotecas genómicas de S. pennellii. Se aislaron 814 clones positivos,
156 clones fueron anclados a 2 de los 5 BINs. La secuencia de los extremos de
estos clones anclados permitió confirmar su posición y establecer, en algunos
casos, el orden relativo entre clones. Asimismo se ha encontrado homología con
regiones codificantes a genes involucrados en el metabolismo (i.e. 4-alpha-glucanotransferasa).
El anclado y secuenciación del total de los clones se encuentra en proceso.
Paralelamente, se seleccionaron 474 marcadores de 16 BINs y se realizaron
exhaustivos análisis por homología en bases de datos. Se identificaron 224
posibles regiones codificantes relacionados al metabolismo, la información de
secuencia disponible de 134 de estas regiones fue utilizada en el diseño de estrategias de aislamiento de los genes
respectivos en S. lycopersicum y S. pennellii. Mediante reacciones de PCR
y secuenciación se han obtenido 49 alelos de S. lycopersicum y 43 alelos de S.
pennellii que están siendo caracterizados. La información genómica
generado en este proyecto tendrá una inmediata aplicación a otras especies de
Solanaceaes dado el alto grado de sintenia entre las mismas con el consecuente
impacto en el proyecto genoma de tomate (S.
lycopersicum) y en proyectos de ingeniería metabólica tendientes a mejorar
caracteres de calidad de los alimentos.