Mapeo del carácter tipo de carpelo en fruto de tomate (Solanum lycopersicum) por secuenciación de grupos discrepantes

VAZQUEZ, DANA V.; PEREIRA DA COSTA, JAVIER H; ILLA-BERENGUER, EUDALD; VAN DER KNAAP, ESTHER; RODRÍGUEZ, GUSTAVO RUBÉN

Montevideo

Congreso; XVI Congreso Latinoamericano de Genética ALAG 2016 y XLV Congreso Argentino de Genética; 2016

El tomate cultivado (Solanum lycopersicum) presenta grandiversidad para la forma de los frutos. El objetivo fue identificar la regióngenómica que controla el tipo de carpelo en los frutos a partir de uncruzamiento intervarietal y por tecnologías de secuenciación de últimageneración. Los progenitores fueron los cultivares Old Brooks y Voyage quedifieren para el carácter tipo de carpelo en los frutos (fusionados vs. nofusionados). Se obtuvo la F1 y por autofecundación una F2compuesta por 76 plantas. Un promedio de 8 frutos por planta fueron cosechadosy visualmente evaluados para el tipo de carpelo. La F1 mostró frutoscon carpelos fusionados y en la F2, 62 plantas tuvieron carpelosfusionados y 14 no fusionados. El carácter segregó 3:1 (χ2=1,12;ns), lo que indicaría que está controlado por un único locus. Se extrajo ADN dehojas jóvenes en 10 plantas F2 que tenían frutos con carpelos nofusionados y 10 plantas con carpelos fusionados. Se mezcló el ADN formando 2bulks (grupos). El ADN (concentración 50 ng/ul) de cada grupo se secuencióen lecturas apareadas de 101 pares de bases (pb) a partir de ambos extremos delADN. Las secuencias se alinearon contra la secuencia del genoma de referencia.Se detectó una región en la posición 41,41 Mb del cromosoma 6 asociada alcarácter tipo de carpelo. Se concluye que en la población segregante elcarácter tipo de carpelo siguió un patrón de segregación mendeliano y que laaplicación de tecnologías de secuenciación de última generación permitióidentificar una región genómica candidata para el control del carácter deinterés.